Robust DNA Isolation and High-throughput Sequencing Library Construction for Herbarium Specimens

Saman Saeidi; Michael R. McKain; Elizabeth A. Kellogg

doi:10.3791/56837

Journal

/

유전학

/

Robuuste DNA isolatie en High-throughput Sequencing bibliotheek bouw voor Herbarium Specimens

JoVE 신문
유전학

JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다. 전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.

JoVE 신문 유전학

Robust DNA Isolation and High-throughput Sequencing Library Construction for Herbarium Specimens

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Robuuste DNA isolatie en High-throughput Sequencing bibliotheek bouw voor Herbarium Specimens

DOI:

10.3791/56837-v

•

13:03 min

•

March 08, 2018

•

Saman Saeidi*¹, Michael R. McKain*^1,2, Elizabeth A. Kellogg

¹Donald Danforth Plant Science Center, ²Department of Biological Sciences,The University of Alabama

Chapters

00:04Title
00:58DNA Extraction
04:39DNA Shearing
05:28Bead Clean-up
07:06Library Preparation
07:40Adaptor Ligation
08:46PCR Amplification
09:12Size Selection for Desired Library Size and Quality Control
11:04Results: Isolation and High-throughput Sequencing of Poor Quality DNA Isolated from Various Herbarium Species
12:33Conclusion

Summary

자동 번역

Dit artikel demonstreert een gedetailleerd protocol voor DNA isolatie en hoge gegevensdoorvoer sequencing bibliotheek bouw van herbarium materiaal met inbegrip van de redding van uitzonderlijk slechte kwaliteit DNA.

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

-Methyl-bindende DNA capture Sequencing for Patient Tissues

Een Robotic Platform voor High-throughput protoplastisola- en Transformatie

Generatie van inheemse chromatine Immunoprecipitation Sequencing bibliotheken nucleosoom dichtheid p.a.

Een universeel Protocol voor grootschalige gRNA bibliotheek productie uit elke bron van DNA

G2-seq: Een High Throughput Sequencing gebaseerde techniek voor het identificeren van laat repliceren regio's van het genoom

Retrospectieve MicroRNA Sequencing: CDNA Bibliotheek voorbereiding Protocol met behulp van formaline-vaste paraffine-ingebedde RNA Specimens

Zeldzame gebeurtenis detectie met behulp van fout-gecorrigeerd DNA en RNA Sequencing

Ultralow Input genoom Sequencing bibliotheek bereiding op basis van een enkel exemplaar van de Tardigrade

High-throughput DNA-extractie en de genotypering van 3dpf Zebrafish larven door Fin knippen

High-throughput identificatie van regelgevende gensequenties met behulp van Next-generation Sequencing van circulaire chromosoom conformatie Capture (4C-seq)

Robuuste DNA isolatie en High-throughput Sequencing bibliotheek bouw voor Herbarium Specimens

•

•

•

Chapters

Summary

자동 번역

Tags

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

-Methyl-bindende DNA capture Sequencing for Patient Tissues

Een Robotic Platform voor High-throughput protoplastisola- en Transformatie

Generatie van inheemse chromatine Immunoprecipitation Sequencing bibliotheken nucleosoom dichtheid p.a.

Een universeel Protocol voor grootschalige gRNA bibliotheek productie uit elke bron van DNA

G2-seq: Een High Throughput Sequencing gebaseerde techniek voor het identificeren van laat repliceren regio's van het genoom

Retrospectieve MicroRNA Sequencing: CDNA Bibliotheek voorbereiding Protocol met behulp van formaline-vaste paraffine-ingebedde RNA Specimens

Zeldzame gebeurtenis detectie met behulp van fout-gecorrigeerd DNA en RNA Sequencing

Ultralow Input genoom Sequencing bibliotheek bereiding op basis van een enkel exemplaar van de Tardigrade

High-throughput DNA-extractie en de genotypering van 3dpf Zebrafish larven door Fin knippen

High-throughput identificatie van regelgevende gensequenties met behulp van Next-generation Sequencing van circulaire chromosoom conformatie Capture (4C-seq)

Read Article