Back to chapter

7.2:

الاصلاح بإستئصال قاعدة

JoVE 핵심
Molecular Biology
This content is Free Access.
JoVE 핵심 Molecular Biology
Base Excision Repair

Languages

소셜에 공유하기

الطريقة الأكثر شيوعًا لإصلاح تلف الحمض النووي 00:00:04.510 00:00:07.510 هو قطع الجزء التالف إعادة نسخ الشريط المكمل الغير التالف ربط و إعادة تلصيق, 00:00:11.980 00:00:13.030 الثغرة هذا التخطيط العام قص ونسخ ولصق يُتّبع في جميع أنواع آلية الإستئصال. تصليح بإستئصال القاعدة أو بى إيه آر, يصحح تلف صغير فى القاعدة حدث بسبب نزع الأمين الأكسدة أو ألكلة والتى تحدث بشكل عفوي أو بسبب السموم البيئية. فى بى إيه آر مجموعة من حوالى 11 إنزيما مختلفا يسمى دى إن إيه جليكوزيلاز تتعرف على قواعد مختلفة متغيرة وتحفز إزالتها.القواعد المعدلة تكّون أزواج قواعد ضعيفة يتم التعرف عليها بواسطة الجليكوزيلاز. 00:00:51.270 00:00:53.940 عند التلاقى مع مثل زوج القواعد الضعيف هذا 00:00:53.940 00:00:57.540 يباعد أزواج القاعدة المجاورة دى إن إيه جليكوزيلاز ويقلب القاعدة المعدلة خارجا. هذه المواجهة تسمح للإنزيم بالتفاعل مع كل جوانب القاعدة لتحديدها بدقة.عند التعرف عليها فإن ال دى إن أيه جليكوزيلاز يشق الرابطة بين قاعدة ال دى إن إيه المعدلة والسكر الريبوزى المنزوع الأكسجين محررا القاعدة الحرة, 00:01:16.020 00:01:18.990 وتاركا فجوة في حلزون الحمض النووي دى إن إيه. يتم التعرف على هذه الفجوة من خلال اندو نوكلياز 00:01:23.160 00:01:26.790 أو أيه بى إيه الذى بجانب أنزيم آخر يسمى فوسفودايستراز يقطع البُنية الأساسية لفسفوديستر داخل سلسلة عديد النوكليوتيدات. القاعدة المفقودة في حلزون الحمض النووي دى إن إيه تملأ بواسطة إنزيم دى إن إيه بوليميراز بيتا والتي 00:01:39.550 00:01:42.460 تنسخ القاعدة الصحيحة من الشريط التكميلي في هذا الموقع.بعد ذلك إنزيم يسمى دى إن أيه لايجاز يغلق باقى الثغرات 00:01:48.370 00:01:52.680 لإعطاء جزيء حمض نووي دى إن إيه مُصحح سليم.

7.2:

الاصلاح بإستئصال قاعدة

أحد الأضرار الشائعة للحمض النووي هو التغيير الكيميائي للقواعد المفردة عن طريق الألكلة أو الأكسدة أو نزع الأمين. تسبب القواعد المتغيرة سوء الاقتران وتكسر الخيوط أثناء النسخ المتماثل. هذا النوع من الضرر يسبب تغيراً طفيفاً في بنية الحلزون المزدوج للحمض النووي و يمكن إصلاحه عن طريق مسارات إصلاح استئصال القاعدة (BER). يصحح BER تسلسل الحمض النووي التالف عن طريق إزالة القاعدة التالفة واستعادة تسلسل القاعدة الأصلي باستخدام الخيط التكميلي كقالب.

تتمثل الخطوة الأولى لـ BER في التعرف على تلف الحمض النووي، والذي يحدث بواسطة جليكوزيلات الحمض النووي. اعتماداً على نوع القاعدة، يقطع جليكوزيلاز معين الرابطة N-جليكوزيديك بين قاعدة النيوكليوتيدات والريبوز، تاركاً العمود الفقري للفوسفات في الحمض النووي سليماً ولكنه يخلق موقعاً أبورينياً أو أبيريميديني (AP). تُحدث إنزيمات الجليكوزيلات ثنائية الوظيفة شقاً في سلسلة الفوسفوديستر، مما يؤدي إلى تكوين 5&#8217؛ أو 3&#8217؛ فوسفات. لا تُظهر إنزيمات الجليكوزيلات أحادية الوظيفة هذه الخاصية ويجب أن تعتمد على نوكلياز AP ​​لشق رابط فوسفات السكر، 5&#8217؛ إلى موقع أبازيك، ينتج 3 & # 8217 ؛ OH و 5 & # 8217 ؛ ديوكسيريبوفوسفات. استناداً إلى اقتران W-C المقابل، يُدرج بوليميراز الحمض النووي القاعدة الصحيحة ويستخدم نشاط AP-لياز المرتبط به لإزالة فوسفات الديوكسيريبوز. يتم ختم النك في العمود الفقري بواسطة DNA ليجاز. يستخدم كل من DNA ليجاز III و DNA بوليميراز البروتين XRCC1 كسقالة لربط موقع الإصلاح.

يمكن أن تؤدي الطفرات في بروتينات مسارات BER إلى أنواع مختلفة من السرطان. على سبيل المثال، ترتبط طفرة في جليكوزيلاز OGG1 البشري بزيادة خطر الإصابة بسرطان الرئة والبنكرياس.

Suggested Reading

  1. Krokan, Hans E., and Magnar Bjørås. "Base excision repair." Cold Spring Harbor perspectives in biology 5, no. 4 (2013): a012583.
  2. Lindahl, Tomas, Peter Karran, and Richard D. Wood. "DNA excision repair pathways." Current opinion in genetics & development 7, no. 2 (1997): 158-169.