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Mineração heurística de genótipos hierárquicos e genoma acessório Loci em populações bacterianas
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Heuristic Mining of Hierarchical Genotypes and Accessory Genome Loci in Bacterial Populations

Mineração heurística de genótipos hierárquicos e genoma acessório Loci em populações bacterianas

DOI:
10.3791/63115-v

•

08:03 min

•

December 07, 2021

•

, ,
1Department of Computer Science and Engineering,University of Nebraska-Lincoln, 2Department of Food Science and Technology,University of Nebraska-Lincoln, 3Nebraska Food for Health Center,University of Nebraska-Lincoln

Chapitres

  • 00:04Introduction
  • 02:23Conduct Analyses and Generate Visualizations
  • 05:17Results: Heuristic Mining of Hierarchical Genotypes and Accessory Genome Loci in Salmonella enterica
  • 06:58Conclusion

Summary

Traduction automatique

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Esta plataforma computacional analítica fornece orientação prática para microbiologistas, ecologistas e epidemiologistas interessados em genômica populacional bacteriana. Especificamente, o trabalho aqui apresentado demonstrou como realizar: i) mapeamento guiado por filogenia de genótipos hierárquicos; ii) análise baseada em frequência de genótipos; iii) análises de parentesco e clonalidade; iv) identificação da linhagem diferenciando loci acessório.

Tags

Heuristic MiningHierarchical GenotypesAccessory Genome LociBacterial PopulationsProkEvoComputational PlatformScalable AnalysisPan-genomic ContentGenotype MappingPathogenic LineagesPublic Health SurveillanceBacterial Population GenomicsGigi TreePhylogenetic TreeData Aggregation

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