Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu. Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Эвристическая добыча иерархических генотипов и локусов генома аксессуаров в бактериальных популяциях
1,872 Views
•
08:03 min
•
December 07, 2021
DOI:
Summary
Automatically generated
Эта аналитическая вычислительная платформа предоставляет практическое руководство для микробиологов, экологов и эпидемиологов, заинтересованных в бактериальной популяционной геномике. В частности, представленная здесь работа продемонстрировала, как выполнять: i) филогенное картирование иерархических генотипов; ii) частотный анализ генотипов; iii) анализ родства и клональности; iv) идентификация родословной, дифференцирующей локусы аксессуаров.
Read Article
Cite this Article
Pavlovikj, N., Gomes-Neto, J. C., Benson, A. K. Heuristic Mining of Hierarchical Genotypes and Accessory Genome Loci in Bacterial Populations. J. Vis. Exp. (178), e63115, doi:10.3791/63115 (2021).
Copy