Summary

Hibridização em Embriões de Zebrafish e Ensaio de Formação de Tubos em iPSC-CEs para estudar o papel da endoglina no desenvolvimento vascular

Published: May 28, 2020
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Summary

Apresentado aqui é um protocolo para análise de hibridização de RNA in situ in situ em zebrafish e ensaio de formação de tubos em células endoteliais derivadas de células-tronco derivadas do paciente para estudar o papel da endoglina na formação vascular.

Abstract

O desenvolvimento vascular é determinado pela expressão sequencial de genes específicos, que podem ser estudados realizando ensaios de hibridização in situ em zebrafish durante diferentes estágios de desenvolvimento. Para investigar o papel da endoglin(eng) na formação de vasos durante o desenvolvimento da telangiectasia hemorrágica hereditária (HHT), o knockdown direcionado mediado por morfina de eng em zebrafish é usado para estudar sua expressão temporal e funções associadas. Aqui, a hibridização de RNA in situ (WISH) é empregada para a análise de eng e seus genes a jusante em embriões de zebrafish. Além disso, os ensaios de formação de tubos são realizados em células endoteliais induzidas pelo paciente HHT (iPSC-ECs; com mutações eng). Um sistema específico de amplificação de sinal usando toda a quantidade In Situ Hybridization – WISH fornece maior resolução e resultados de fundo mais baixos em comparação com os métodos tradicionais. Para obter um sinal melhor, o tempo de pós-fixação é ajustado para 30 minutos após a hibridização da sonda. Como a coloração da fluorescência não é sensível em embriões de zebrafish, ela é substituída por coloração diaminobezidina (DAB) aqui. Neste protocolo, as linhas iPSC derivadas do paciente HHT contendo uma mutação eng são diferenciadas em células endoteliais. Depois de revestir uma placa com matriz de membrana de porão por 30 min a 37 °C, os iPSC-CE são semeados como monocamadas em poços e mantidos a 37 °C por 3h. Em seguida, o comprimento do tubo e o número de ramos são calculados usando imagens microscópicas. Assim, com este protocolo WISH melhorado, mostra-se que a expressão eng reduzida afeta a formação de progenitores endoteliais em embriões de zebrafish. Isso é confirmado ainda por ensaios de formação de tubos utilizando iPSC-CEs derivados de um paciente com HHT. Esses ensaios confirmam o papel do eng no desenvolvimento vascular precoce.

Introduction

Uma única mutação no eng (CD105) foi relatada em pacientes com HHT. A mutação leva ao aumento da proliferação da CE e à redução do alongamento da CE mediada pelo fluxo1,,2. Também foi relatado anteriormente que a deficiência de ENG reduz a expressão de marcadores endoteliais (ou seja, kdrl, cdh5, hey2) em zebrafish3. Endoglin, expressa principalmente em células endoteliais, é uma glicoproteína transmembrana e funciona como um co-receptor para transformar o fator de crescimento β (TGF-β) membros da família. Ele direciona a ligação BMP9 na superfície celular para regular o gene a jusante, incluindo a expressão Id1, para induzir a diferenciação de células-tronco em relação aos CE4. Assim, o gene eng desempenha papéis importantes na vasculogênese e na doença vascular humana5,6. Examinamos anteriormente os efeitos da derrubada de endoglin na formação de vasos em embriões de zebrafish, seguido pela análise de CEs derivados de iPSCs adquiridos de um paciente com HHT com uma mutação eng 7. Este protocolo demonstra os efeitos da deficiência de ENG na expressão do marcador progenitor endotelial e na formação de tubos, que é um método quantificável para medir angiogênese in vitro.

Para estudar a expressão espacial e temporal, o WISH é empregado para detectar a expressão genética in vivo8. A hibridização in situ (ISH) é um método de uso de sondas rotuladas com sequências complementares de ácidos nucleicos-alvo (DNA ou mRNA) para detectar e visualizar híbridos de ácido nucleico alvo em uma amostra fixa. O processo amplifica sinais de expressão genética in vivo e é usado para detectar a expressão de genes por microscopia. A WISH tem sido amplamente utilizada em vários animais modelo, especialmente em zebrafish9. Também é usado para adquirir os seguintes dados: 1) padrões de expressão espacial/temporal genética, que fornecem informações sobre a função e classificação genética; e 2) marcadores genéticos expressos especificamente que são usados em drogas de alta produtividade ou triagem mutante10.

As sondas cromogênicas são facilmente degradadas com o cromossomo tradicional in situ hibridização (CISH), o que resulta em alto ruído de fundo e sinais inespecíficos11,12. O método WISH usa duas sondas Z duplas independentes, que são projetadas para hibridizar para atingir sequências de RNA. Cada sonda contém uma sequência de 18-25 complementar ao RNA alvo e uma sequência de cauda base de 14 (conceitualizada como Z). As sondas-alvo são usadas em um par (duplo Z). As duas sequências de cauda juntas formam um local de hibridização de 28 bases para o pré-amplificador, que contém 20 locais de ligação para o amplificador. O amplificador, por sua vez, contém 20 sites de vinculação para a sonda de etiqueta e pode teoricamente render até 8.000 etiquetas para cada sequência de RNA de destino.

Esta tecnologia avançada facilita a amplificação simultânea de sinal e a supressão de fundo para alcançar a visualização de molécula única, preservando a morfologia tecidual13. Outra modificação dos métodos WISH baseia-se em pesquisas anteriores14, incluindo fixação extra e coloração da DAB. Desde aqui está um protocolo WISH melhorado que pode funcionar mesmo que o RNA alvo seja parcialmente diminuído ou degradado. As vantagens incluem que ele pode ser concluído em 24 horas sem condições livres de RNase. Os sinais também podem ser detectados simultaneamente através de vários canais de vários alvos, e os resultados são consistentes e compatíveis com resultados de diferentes plataformas de automação de alto rendimento.

Os resultados de modelos animais não refletem o mesmo fenômeno que ocorre em humanos. A ENG contém dois pares de cisteínas conservadas, C30-C207 e C53-C182, que formam pontes de dissulfeto em regiões órfãs. Para estudar melhor o papel do eng em pacientes com HHT, ensaios de formação de tubos com iPSCs derivados de pacientes com HHT têm sido realizados em células sem/com mutações eng (Cys30Arg, C30R)15. Depois que Kubota et al. relataram pela primeira vez o experimento de formação detubos 16,o ensaio foi desenvolvido de várias maneiras. Tem sido usado para identificar fatores angiogênicos ou antiangiogênicos, definir as vias de sinalização na angiogênese e identificar genes que regulam a angiogênese17.

Antes da disponibilidade de iPSC-CE derivados do paciente, os pesquisadores usavam eCs principalmente cultos para estudar angiogense16. No entanto, para as células endoteliais, é um desafio técnico transduir genes exógenos com um vírus, devido ao número de passagem limitado que as CEs podem sofrer. Isso porque não há material celular suficiente para ser coletado de vasos humanos, seja de cirurgia ou doadores aprovados. Com a invenção da técnica de geração iPSC por Shinya Yamanaka, os CEs humanos derivados de iPSCs podem ser usados de forma confiável em experimentos in vitro, como relatado anteriormente18.

O uso de CEs transduzidas viralmente com números e passagens limitadas pode ser suficiente para estudos de sinalização, mas para estudos funcionais, é melhor gerar linhas de células-tronco pluripotentes mutantes, (iPSCs ou hESCs alvo CRISPER/Cas9), em seguida, diferenciá-los em CEs para estudos de angiogênese que usam ensaios de formação de tubos19. A formação de tubos pode ser usada para avaliar a função das células endoteliais que carregam mutações. Este protocolo também descreve a formação de tubos em uma placa de angiogênese de μ-slide, que é um método fácil, econômico e reprodutível.

O protocolo abaixo fornece um método confiável e sistêmico para estudar o papel de genes específicos na formação vascular, juntamente com detalhes para o padrão de expressão in vivo e quantificação funcional in vitro para modelagem de doenças humanas.

Protocol

Todos os experimentos em animais descritos foram aprovados pelo Comitê de Ética em Pesquisa da Faculdade de Medicina da Universidade de Zhejiang. 1. Hibridização total in situ Criação e reprodução da linha zebrafish Alimente e levante todos os zebrafish adultos a 26-28 °C em um sistema de aquicultura recirculante com 14 h de ciclo escuro de luz/10h para cada dia. Use linhas de zebrafish AB (tipo selvagem) para os seguintes procedimentos. Coloque uma camada…

Representative Results

A hibridização total do situ baseia-se em um princípio semelhante à transferência de energia de ressonância fluorescência. Ele foi projetado para melhorar a sensibilidade e a especificidade no ISH de zebrafish, bem como amplificar sinais específicos de alvo sem afetar o sinal de fundo. Em embriões de zebrafish de 24 hpf, a endoglina é altamente expressa na veia cardeal posterior (PCV), vasos intersegmentais (I…

Discussion

Este protocolo aplicou uma melhor plataforma de análise de RNA in situ in situ para ensaios de formação de zebrafish e tubos em iPSC-CEs derivados de um paciente HHT. O método ISH tradicional requer um ciclo experimental mais longo com etapas experimentais extras. O protocolo possui algumas melhorias importantes, o uso de sondas independentes duplas Z e iPSCs derivados de um paciente com HHT que foram aplicados em ensaios WISH e formação de tubos, respectivamente. Esses refinamentos são cruciais para aumentar a se…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Este trabalho foi apoiado por subsídios do Programa Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento de Células-Tronco da China e pesquisa translacional [número de subvenção 2016YFA0102300 (para Jun Yang)];a Nature Science Foundation of China [número de subvenção 81870051, 81670054 (para Jun Yang)]; o CAMS Innovation Fund for Medical Sciences (CIFMS) [número de subvenção 2016-I2M-4-003 (para Jun Yang)]; o PUMC Youth Found e o Fundamental Research Funds for the Central Universities [número de subvenção 2017310013 (para Fang Zhou)].

Materials

µ-Slide Angiogenesis ibidi 81506 Cell culture
Amp 1-FL ACD SDS 320852 Signal Amplification
Amp 2-FL ACD SDS 320853 Signal Amplification
Amp 3-FL ACD SDS 320854 Signal Amplification
Amp 4 Alt B-FL ACD SDS 320856 Signal Amplification
Corning Matrigel Matrix Corning 354234 Growth factor-reduced Matrigel
DEPC Sigma D5758 RNAase-free Water
Human Endothelial-SFM Thermofisher 11111044 Cell culture
Paraformaldehyde Sigma 30525-89-4 Fixed embryos
Paraformaldehyde Sigma 30525-89-4 Fixed Cells
Protease K ACD SDS 322337 Digest tissue
Sodium Citrate Sigma 6132-04-3 SSCT solution: Wash Buffer
VEGF-165 STEMCELL Technologies 78073 Growth factor

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Wang, Y., Zhang, D., Zhou, F., Zhou, M., Li, Q., Chen, J., Yang, J. Whole-Mount In Situ Hybridization in Zebrafish Embryos and Tube Formation Assay in iPSC-ECs to Study the Role of Endoglin in Vascular Development. J. Vis. Exp. (159), e60498, doi:10.3791/60498 (2020).

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