Journal
/
Developmental Biology
/
AMEBaS: estrazione automatica della linea mediana e sottrazione di fondo di time-lapse di fluorescenza raziometrica di singole cellule polarizzate
JoVE Journal
Developmental Biology
Author Produced
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Developmental Biology
AMEBaS: Automatic Midline Extraction and Background Subtraction of Ratiometric Fluorescence Time-Lapses of Polarized Single Cells
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

AMEBaS: estrazione automatica della linea mediana e sottrazione di fondo di time-lapse di fluorescenza raziometrica di singole cellule polarizzate

italiano

Automatically Generated

326 Views

•

06:03 min

•

June 23, 2023

DOI:

10.3791/64857-v

DOI:
10.3791/64857-v

•

06:03 min
June 23, 2023

•

1 Views
, , , , , , ,
1Institute of Mathematics and Statistics,University of São Paulo, 2Center for Mathematics, Computing and Cognition,Federal University of ABC, 3Department of Botany, Institute of Biosciences,University of São Paulo, 4Cell Biology and Molecular Genetics Department,University of Maryland, 5Department of Biosciences,University of Milan, 6Department of Physics,Politecnico di Milano

Summary

Automatically generated

Gli attuali metodi per analizzare la dinamica intracellulare delle singole cellule polarizzate sono spesso manuali e mancano di standardizzazione. Questo manoscritto introduce una nuova pipeline di analisi delle immagini per automatizzare l'estrazione della linea mediana di singole cellule polarizzate e quantificare il comportamento spazio-temporale dai time lapse in un'interfaccia online di facile utilizzo.

Explore More Videos

AMEBaSMidline ExtractionBackground SubtractionRatiometric FluorescenceTime-lapsePolarized Single CellsAutomationCell SegmentationCell Midline TracingSkeletonizationLinear ExtrapolationInterpolation

Read Article

Cite this Article

Badain, R., Damineli, D. S. C., Portes, M. T., Feijó, J., Buratti, S., Tortora, G., Neves de Oliveira, H., Cesar Jr, R. M. AMEBaS: Automatic Midline Extraction and Background Subtraction of Ratiometric Fluorescence Time-Lapses of Polarized Single Cells. J. Vis. Exp. (196), e64857, doi:10.3791/64857 (2023).

Download .ris file

Copy

Share Video

.

Copy