Journal
/
Genetics
/
אפיון זן Escherichia coli פתוגני שמקורו באוראוכרומיס spp. חוות המשתמשות בריצוף גנום שלם
JoVE Journal
Genetics
Author Produced
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Characterization of a Pathogenic Escherichia coli Strain Derived from Oreochromis spp. Farms Using Whole-Genome Sequencing
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

אפיון זן Escherichia coli פתוגני שמקורו באוראוכרומיס spp. חוות המשתמשות בריצוף גנום שלם

DOI:
10.3791/64404-v

•

09:44 min

•

December 23, 2022

•

, , ,
1Unidad de Investigaciones en Salud Pública “Dra. Kaethe Willms”, Facultad de Ciencias Químico Biológicas,Universidad Autónoma de Sinaloa, 2Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A. C. (CIAD),Unidad Mazatlán en Acuicultura y Manejo Ambiental

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:32DNA Library Preparation
  • 04:15Library Pooling, Denaturalizing, Sequencer Initiating
  • 07:05Sequence Data Analysis
  • 08:07Results: Circular Map and Subsystem Distribution of Draft Genome of E. coli ACM5
  • 09:15Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

ההיתכנות של אסטרטגיות ריצוף גנום שלם (WGS) באמצעות מכשירי benchtop פישטה את חקירת הגנום של כל מיקרוב בעל רלוונטיות לבריאות הציבור בסביבה מעבדתית. מתוארת התאמה מתודולוגית של זרימת העבודה עבור WGS חיידקי ומוצג גם צינור ביואינפורמטיקה לניתוח.

Tags

Whole-genome SequencingWGSAntimicrobial ResistancePathogenic Escherichia ColiOreochromis Spp. FarmsNext-generation SequencingDNA ExtractionTagmentationIndexingPCRMagnetic Bead Purification

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

איתור של שינוי מספר העתקה באמצעות רצף תא יחיד

קביעת Location(s) כרומוזומלית האופטימלית עבור רכיב ה-DNA ב- Escherichia coli באמצעות גישה מוזרה בתיווך Transposon

מהדור ג'ין-שיבשו סטרפטוקוקוס mutans זן בלי ג'ין שיבוט

אירוע נדיר איתור שגיאות DNA ו RNA רצף

הגנום קלט ultralow רצף ספריית הכנה מ להצטננות Tardigrade

הגברה של יד באורך מלא הפרו-וירוס HIV-1 עבור הדור הבא רצפי

זיהוי תפוקה גבוהה של ג'ין רצפים תקינה באמצעות רצף הדור הבא של כרומוזום מעגלי קונפורמציה ללכוד (4C-seq)

הפקת ג'ין מחיקות ב- Escherichia coli מאת P1 התמרה חושית עם קלטות עמידות לאנטיביוטיקה ניתן לניתוח

בידוד, קביעת רצף וניתוח מיקרו Rna חוץ-תאי של גזע Mesenchymal אנושי

רצף של mRNA מתוך דם שלם באמצעות רצפי Nanopore

Read Article