Journal
/
Genetics
/
Kısa ve Uzun Süredir Okunan Dizileme Teknolojilerini Kullanarak İdrar Bakterilerinin Tam Genomlarının Üretilmesi için Hibrit De Novo Genom Montajı
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetics
Hybrid De Novo Genome Assembly for the Generation of Complete Genomes of Urinary Bacteria using Short- and Long-read Sequencing Technologies
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Kısa ve Uzun Süredir Okunan Dizileme Teknolojilerini Kullanarak İdrar Bakterilerinin Tam Genomlarının Üretilmesi için Hibrit De Novo Genom Montajı

Türkçe

Automatically Generated

4,470 Views

•

12:08 min

•

August 20, 2021

DOI:

10.3791/62872-v

DOI:
10.3791/62872-v

•

12:08 min
August 20, 2021

•

39 Views
, , , , ,
1Department of Biological Sciences,University of Texas at Dallas, 2Department of Urology,University of Texas Southwestern Medical Center

Summary

Automatically generated

Bu protokol, üriner bakterilerin kültleme, dizileme ve de novo hibrid genom montajı için kapsamlı bir yaklaşımı detaylandırmak. İdrar kolonizasyonuna, patogeneze ve antimikrobiyal direncin yayılmasına katkıda bulunan kromozomal ve ekstrakrozomal genetik elementlerin incelenmesinde yararlı olan tam, dairesel genom dizilerinin üretimi için tekrarlanabilir bir prosedür sağlar.

Explore More Videos

Hybrid Genome AssemblyUrinary BacteriaShort-read SequencingLong-read SequencingComplete GenomesGenome ArchitectureMobile Genetic ElementsCulturable BacteriaGenome ContentAdapter LigationFlow Cell PrimingDNA Library PreparationSequencing Run

Read Article

Cite this Article

Sharon, B. M., Hulyalkar, N. V., Nguyen, V. H., Zimmern, P. E., Palmer, K. L., De Nisco, N. J. Hybrid De Novo Genome Assembly for the Generation of Complete Genomes of Urinary Bacteria using Short- and Long-read Sequencing Technologies. J. Vis. Exp. (174), e62872, doi:10.3791/62872 (2021).

Download .ris file

Copy

Share Video

.

Copy