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細胞型特異的スケールでのシロイヌナズナ・タリアナの開発を調査するためのリボソーム親和性精製(TRAP)の翻訳
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JoVE Journal Developmental Biology
Translating Ribosome Affinity Purification (TRAP) to Investigate Arabidopsis thaliana Root Development at a Cell Type-Specific Scale
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細胞型特異的スケールでのシロイヌナズナ・タリアナの開発を調査するためのリボソーム親和性精製(TRAP)の翻訳

日本語

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09:41 min

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May 14, 2020

DOI:

10.3791/60919-v

DOI:
10.3791/60919-v

•

09:41 min
May 14, 2020

•

8 Views
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1Department of Plant and Microbial Biology,University of Zurich, 2Biophore – UNIL, 3Laboratory of Cell and Molecular Biology, Institute of Biology,University of Neuchâtel

Summary

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リボソームアフィニティー精製(TRAP)を翻訳すると、臓器や組織の最小限の処理で開発プログラムを解剖する可能性があります。このプロトコルは、緑色蛍光タンパク質(GFP)標識リボソームサブユニットを標的とした細胞から高品質のRNAを生成します。qRT-PCR や RNA-seq などのダウンストリーム解析ツールは、組織および細胞の種類特異的発現プロファイルを明らかにします。

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Ribosome Affinity Purification (TRAP)Arabidopsis ThalianaRoot DevelopmentCell Type-specificPolysome RNALow-input RNALateral Root FormationCell-cell CommunicationCell WallMechanical SignalingSeed SterilizationExogenous TreatmentNAA

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Thellmann, M., Andersen, T. G., Vermeer, J. E. Translating Ribosome Affinity Purification (TRAP) to Investigate Arabidopsis thaliana Root Development at a Cell Type-Specific Scale. J. Vis. Exp. (159), e60919, doi:10.3791/60919 (2020).

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