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L’extraction du génome guidée par spectrométrie de masse comme outil pour découvrir de nouveaux produits naturels
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Mass Spectrometry-Guided Genome Mining as a Tool to Uncover Novel Natural Products
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L’extraction du génome guidée par spectrométrie de masse comme outil pour découvrir de nouveaux produits naturels

français

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11:13 min

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March 12, 2020

DOI:

10.3791/60825-v

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10.3791/60825-v

•

11:13 min
March 12, 2020

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1Department of Organic Chemistry, Institute of Chemistry,University of Campinas (UNICAMP), 2Center for Natural and Human Sciences,Federal University of ABC (UFABC)

Summary

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Un protocole d’extraction du génome guidé par spectrométrie de masse est établi et décrit ici. Il est basé sur l’information sur la séquence génomique et l’analyse LC-MS/MS et vise à faciliter l’identification des molécules à partir d’extraits microbiens et végétaux complexes.

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Mass SpectrometryGenome MiningNatural Product DiscoveryMolecular NetworkingWhole Genome SequencingGenotype-to-chemotypeBiosynthetic ClustersSecondary MetabolismGNPSStreptomycesFungiPlants

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Sigrist, R., Paulo, B. S., Angolini, C. F. F., De Oliveira, L. G. Mass Spectrometry-Guided Genome Mining as a Tool to Uncover Novel Natural Products. J. Vis. Exp. (157), e60825, doi:10.3791/60825 (2020).

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