Journal
/
Chemistry
/
Mass Spectrometry-Guided Genome Mining als een instrument om nieuwe natuurlijke producten te ontdekken
JoVE Journal
Chemistry
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Chemistry
Mass Spectrometry-Guided Genome Mining as a Tool to Uncover Novel Natural Products
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Mass Spectrometry-Guided Genome Mining als een instrument om nieuwe natuurlijke producten te ontdekken

DOI:
10.3791/60825-v

•

11:13 min

•

March 12, 2020

•

, , ,
1Department of Organic Chemistry, Institute of Chemistry,University of Campinas (UNICAMP), 2Center for Natural and Human Sciences,Federal University of ABC (UFABC)

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 02:54Genome Mining for Biosynthetic Gene Clusters
  • 03:46Strain Cultivation
  • 04:51Acquiring Mass Spectra and Preparation for GNPS Analysis
  • 05:43GNPS Analysis
  • 08:33Results: Genome Sequence Analysis and Molecular Networking
  • 09:46Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Een massaspectrometrie-geleide genoom mijnbouw protocol is hier vastgesteld en beschreven. Het is gebaseerd op genoomsequentie-informatie en LC-MS/MS-analyse en heeft tot doel de identificatie van moleculen uit complexe microbiële en plantenextracten te vergemakkelijken.

Tags

Mass SpectrometryGenome MiningNatural Product DiscoveryMolecular NetworkingWhole Genome SequencingGenotype-to-chemotypeBiosynthetic ClustersSecondary MetabolismGNPSStreptomycesFungiPlants

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Chemische Gardens als doorstroomreactoren simuleren Natural Hydrothermal Systems

Een Direct, Early Stage Guanidinylation protocol voor de synthese van complexe-Aminoguanidine bevattende Natural Products

Laboratorium productie van biobrandstoffen en Biochemicals uit een Koolzaadolie door middel van katalytisch kraken Conversion

NMR-spectroscopie als een robuust hulpmiddel voor de snelle evaluatie van het lipidenprofiel van visolie supplementen

Coulomb explosie Imaging als een instrument om te onderscheiden tussen stereo-isomeren

Elektrochemische impedantie spectroscopie als een instrument voor elektrochemische Rate Constant schatting

Color Spot Test als een vermoedelijke instrument voor de snelle detectie van synthetische Cathinones

Nieuwe technieken voor het observeren van structurele dynamica van Photoresponsive vloeibare kristallen

Drukkend warm Water extractie (PHWE) om te verkennen van natuurproducten chemie in het Undergraduate laboratorium in dienst

Een twee-stap pyrolyse-Gas Chromatografie methode met massa spectrometrische detectie voor de identificatie van tatoeage inkt ingrediënten en namaakproducten

Read Article