Конвейер биоинформатики, а именно miRDeep-P2 (miRDP2 для краткости), с обновленными критериями miRNA растений и пересмотренным алгоритмом, может точно и эффективно анализировать транскриптомы микроРНК в растениях, особенно для видов со сложными и крупными геномами.