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Transcription Start Site Mapping Using Super-low Input Carrier-CAGE
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Transkription Start Site Mapping mit Super-low Input Carrier-CAGE

Deutsch

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06:59 min

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June 26, 2019

DOI:

10.3791/59805-v

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10.3791/59805-v

•

06:59 min
June 26, 2019

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1Institute of Clinical Sciences, Faculty of Medicine,Imperial College London, 2MRC London Institute of Medical Sciences, 3Sars International Centre for Marine Molecular Biology,University of Bergen

Summary

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Cap Analysis of Gene Expression (CAGE) ist eine Methode zur genomweiten quantitativen Kartierung von mRNA 5'ends zur Erfassung von RNA-Polymerase-II-Transkriptionsstartstellen mit einer einzigen Nukleotid-Auflösung. Diese Arbeit beschreibt ein Low-Input-Protokoll (SLIC-CAGE) zur Erzeugung hochwertiger Bibliotheken mit Nanogramm-Mengen von Gesamt-RNA.

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Transcription Start Site MappingSLIC-CAGECarrier-CAGERNA Polymerase IIGene RegulationCore PromoterEnhancer DiscoveryDiagnostic MarkersEmbryonic DevelopmentReverse TranscriptionSPRI Magnetic Beads

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Cvetesic, N., Pahita, E., Lenhard, B. Transcription Start Site Mapping Using Super-low Input Carrier-CAGE. J. Vis. Exp. (148), e59805, doi:10.3791/59805 (2019).

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