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Adattamento di ibridazione catturare delle proteine della cromatina associate per proteomica per cellule di mammifero
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Adaptation of Hybridization Capture of Chromatin-associated Proteins for Proteomics to Mammalian Cells
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Adattamento di ibridazione catturare delle proteine della cromatina associate per proteomica per cellule di mammifero

italiano

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09:27 min

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June 01, 2018

DOI:

10.3791/57140-v

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10.3791/57140-v

•

09:27 min
June 01, 2018

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1Department of Genetics,Texas Biomedical Research Institute, 2Department of Internal Medicine-Molecular Medicine,Wake Forest University School of Medicine, 3Department of Chemistry,University of Wisconsin

Summary

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Si tratta di un metodo per identificare nuove proteine che interagiscono con DNA loci target specifico, basandosi sull'acquisizione di sequenza-specifico della cromatina reticolato per analisi proteomica successive. Alcuna conoscenza pregressa potenziali proteine leganti, né modifiche di cella non sono necessari. Inizialmente sviluppato per il lievito, la tecnologia ora è stata adattata per cellule di mammifero.

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Hybridization CaptureChromatin-associated ProteinsProteomicsMammalian CellsGenome RegulationDNA Binding ProteinsCell CultureCross-linkingFormaldehydeGlycine

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Guillen-Ahlers, H., Rao, P. K., Perumalla, D. S., Montoya, M. J., Jadhav, A. Y., Shortreed, M. R., Smith, L. M., Olivier, M. Adaptation of Hybridization Capture of Chromatin-associated Proteins for Proteomics to Mammalian Cells. J. Vis. Exp. (136), e57140, doi:10.3791/57140 (2018).

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