/

/

レトロウイルススキャン：細胞特異的調節領域を定義するためのMLV統合サイトのマッピング

JoVE Journal
Genetics

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Genetics

Retroviral Scanning: Mapping MLV Integration Sites to Define Cell-specific Regulatory Regions

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

レトロウイルススキャン：細胞特異的調節領域を定義するためのMLV統合サイトのマッピング

DOI:

10.3791/55919-v

•

10:10 min

•

May 28, 2017

•

Oriana Romano², Ingrid Cifola, Valentina Poletti, Marco Severgnini, Clelia Peano, Gianluca De Bellis, Fulvio Mavilio⁴, Annarita Miccio^2,4,5

¹Center for Genome Research, Department of Life Sciences,University of Modena and Reggio Emilia, ²Laboratory of Chromatin and Gene Regulation During Development,Imagine Institute, ³Institute for Biomedical Technologies,CNR, ⁴Généthon, ⁵Sorbonne Paris Cité – Université Paris Descartes

Chapters

00:05Title
00:45MLV Transduction of Human Cells
01:41Restriction Enzyme Digestion and Linker Ligation
03:05First-round Linker-mediated PCR
03:43Second Round Linker-mediated PCR
05:17Library Preparation and Dilution for Massive Sequencing of MLV Integration Sites
07:53Results: Mapping MLV Integration into Epigenetically-defined Regulatory Regions
09:23Conclusion

Summary

Automatic Translation

ここでは、ヒト細胞におけるモロニーマウス白血病ウイルスベースのレトロウイルスベクターの組み込み部位のゲノムワイドマッピングのためのプロトコールについて記載する。

Tags

Keywords: Retroviral Scanning MLV Integration Sites Cell-specific Regulatory Regions Gene Therapy Gene Regulation MLV-derived Retroviral Vector EGFP Reporter Gene Flow Cytometric Analysis Genomic DNA Preparation Restriction Enzyme Digestion Linker Ligation First-round PCR Second-round PCR

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

QTLマッピングとCRISPR / Cas9編集による薬剤耐性遺伝子同定<em> Toxoplasma gondii</em

ビオチン化ソラレンを用いたRNA-RNA相互作用のマッピング

双方向レトロウイルスの統合サイトPCRの方法論と定量的データ解析ワークフロー

G2-seq: 高スループットシーケンスベースを識別する方法後半ゲノムの領域を複製します。

哺乳類細胞におけるメジャークロマチンアクセシビリティ規制要素のホルムアルデヒドによる分離

翻訳後修飾とバリアントの高速、定量的な方法はペプチドのゲノムへのマッピングを有効に

ホスホロチオエートを使用して RNA の結合蛋白質の新規飽和突然変異誘発方法: シングルステップの特性

円の染色体構造の次世代シーケンシングによる遺伝子制御配列の高スループット識別キャプチャ (4 C seq)

ホットスポット領域の変異の包括的かつ同時検出のための単一液滴デジタルポリメラーゼの連鎖反応

調節RNA結合タンパク質の結合部位を同定するための配列空間の探索

Read Article