Здесь мы представляем протокол, чтобы точная количественная оценка митохондриальной ДНК (мтДНК) метилирование. В этом протоколе мы описываем ферментативного пищеварения ДНК с BamHI в сочетании с bioinformatic анализа трубопровода, который может использоваться для избежания переоценки мтДНК метилирования уровней, вызванные вторичную структуру мтДНК.