דור שמסווגת נוגדנים חד-שבטיים אנושי מתאי B אנטיגן ספציפי נדיר במחזור הדם
Summary
אנו מתארים שיטה לייצור נוגדנים אנושי ספציפי אנטיגן של עניין, מתחיל מתאי B נדיר במחזור דם אנושי. דור של נוגדנים טבעיים אלה הוא יעיל ומהיר, הנוגדנים שהושג יכול להפלות בין אנטיגנים מאוד קשורות.
Abstract
נוגדנים חד-שבטיים (mAbs) הינם כלים רבי-עוצמה שימושי עבור שניהם מחקר בסיסי ב וההתערבות. ירידה לפרטים גבוהה שלהם היא הכרחית כאשר הנוגדן צריך להבחין בין מבנים הקשורים במידה רבה (למשל, חלבון רגיל, גרסה מוטציה הימנו). הדרך הנוכחית של יצירת mAbs שמסווגת כזה כרוך ההקרנה נרחב של תאים מייצרי Ab B מרובים, וזה גם יקר וגם זמן רב. אנו מציעים כאן שיטה מהירה וחסכונית לדור של שמסווגת, mAbs אנושית לחלוטין, החל מדם אנושי במחזור B לימפוציטים. מקוריות אסטרטגיה זו נובעת בחירת התאים איגוד B אנטיגן ספציפי בשילוב עם מבחר הנגד של כל התאים האחרים, שימוש זמינים היקפיים דם תאי תאים (PBMC). ברגע מסוים B תאים מבודדים, רצפים cDNA (חומצה deoxyribonucleic משלימים) קידוד mAb המתאימים מתקבלים תא בודד הפוך תמלול-תגובת שרשרת פולימראזית (RT-PCR) בטכנולוגיית והביע לאחר מכן-אנוש תאים. בתוך מעט ככל 1 חודש, זה אפשרי לייצר מיליגרם של mAbs אנושי מאוד שמסווגת נגד כמעט כל אנטיגן הרצוי באופן טבעי שזיהה את הרפרטואר תא B.
Introduction
השיטה המתוארת כאן מאפשרת ייצור מהיר ופסיביות של נוגדנים חד-שבטיים אנושית לחלוטין (mAbs) נגד אנטיגן הרצוי (Ag). mAbs הם כלים חיוניים רבים מחקר בסיסי יישומים בתוך חוץ גופית ו ויוו: flow cytometry, היסטולוגיה, ניסויים סופג המערבי, ואת החסימה לדוגמה. יתר על כן, mAbs נמצאים בשימוש יותר תרופות לטיפול במחלות אוטואימוניות, סרטן, וכדי לשלוט דחייה השתלת1. לדוגמה, mAbs אנטי-CTLA-4 ו- anti-PD-1 (או אנטי-PD-L1) לאחרונה שימשו מעכבי המערכת החיסונית מחסום טיפולי סרטן2.
MAbs הראשונה יוצרו על ידי אימונוגלובולין (Ig)-מפריש hybridomas המתקבל תאי הטחול של חיסון עכברים או חולדות. עם זאת, התגובה החיסונית חזקה נגד mAbs מאתר או עכברוש הסלים שלהם לשימוש טיפולית בבני אדם, בשל הסיווג שלהם מהירה של אינדוקציה סביר של רגישות יתר תגובות3. כדי להתמודד עם בעיה זו, פרוטאין מהחי רצפים של mAbs הוחלפו חלקית על-ידי אלה האדם לייצר נוגדנים העכבר-אנושי או humanized chimeric כביכול. עם זאת, אסטרטגיה זו פוחתת באופן חלקי בלבד immunogenicity, תוך הגדלת באופן משמעותי הן את העלות והן ציר-הזמן של ייצור. פתרון טוב יותר היא לייצר mAbs האנושי ישירות מתאי B האנושית, מספר אסטרטגיות זה הינם זמינים. אחד מהם הוא השימוש של תצוגת phage או שמרים. זה כולל הצגת תחומים משתנים מספרייה קומבינטורית של Ig אדם אקראי כבד, אור שרשראות phages או שמרים, ולא בביצוע שלב הבחירה באמצעות אנטיגן ספציפי של עניין. חיסרון גדול של אסטרטגיה זו היא שרשראות קלות וכבדות מקושרים באקראיות, שמוביל עלייה גדולה מאוד הרב-גוניות של נוגדנים שנוצרו. נוגדנים שהושג סביר להניח תואמים לאלה הנובעים מן תגובה חיסונית טבעית נגד Ag מסוים. יתר על כן, קיפול חלבונים האנושית והשינויים post-translational לא באופן שיטתי משוחזרות אאוקריוטים או אפילו בכל שמרים. שיטת הייצור mAb האדם השני הוא immortalization של תאים B אנושי טבעי, על ידי וירוס אפשטיין בר זיהום או ביטוי של גורמים אנטי-מוות BCL-6 ו- BCL-XL4. אולם, שיטה זו ישימה רק לתאי זיכרון B, הוא יעיל, הדורשים הקרנת רבים mAb immortalized B והתאים המייצרים לזהות שיבוטים mAb כמה (אם בכלל) עם יחודיות antigenic הרצוי. השיטה זו וכך גם יקר וגם זמן רב.
פרוטוקול חדש לאחרונה תואר לייצור mAbs אנושית מבודדת אחת B תאים5. זה מסתמך על אופטימיזציה בתא יחיד הפוך תמלול-תגובת שרשרת פולימראזית (RT-PCR) עבור הגברה של שני כבדים – ו אור-שרשרת קידוד מקטעי מתא B ממוינת יחידה. זה מלווה את שיבוט וביטוי של מקטעים אלה במערכת הביטוי האיקריוטים, ובכך לאפשר שחזור של mAb אנושית לחלוטין. פרוטוקול זה שימש בהצלחה מתחיל מתאי B מתורמים שחוסנו. תאים נבצרו מספר שבועות לאחר החיסון כדי להשיג תדרים גבוהים יותר של תאי B נגד היועץ המשפטי לממשלה הרצוי, ואת ובכך להגביל את משך הזמן הדרוש לסינון6. אחרים mAbs אנושית לחלוטין גם הופקו נשאי איידס+ (וירוס הכשל החיסוני האנושי) חולים7 ו מלנומה מטופלים8. למרות ההתפתחויות הללו, יש עדיין אין הליך זמין המאפשר את הבידוד של תאים ספציפיים Ag B עצמאית של פנוטיפ זיכרון או התדירות שלהם.
ההליך שמתואר כאן מוביל בידוד יעיל ex-vivo של תאי B במחזור אדם המבוסס על ירידה לפרטים BCR שלהם, ואחריו את הייצור של mAbs אנטיגן ספציפי אנושית לחלוטין תשואה גבוהה ועם זמן הקרנה נמוכה. השיטה אינה מוגבלת זיכרון B תאים או מפריש נוגדן תאי B המושרה לאחר תגובה חיסונית, אך ניתן להחיל גם על הרפרטואר תא B נאיבי האדם. זה עובד אפילו מתחיל מתאי B הספציפיים Ag, נוכח תדרים נמוכים מאוד היא אינדיקציה טובה של היעילות שלה. העקרון של השיטה הוא כדלקמן: היקפי דם תאי תאים (PBMC) מוכתמים tetramers שני מציג אנטיגן של עניין, כל אחת המסומנת fluorochrome שונים (למשל, Phycoerythrin (PE), Allophycocyanin (APC)), tetramer השלישי מציג אנטיגן הקשורים קשר הדוק מצומדת עם fluorochrome השלישי (למשל, 421 ויולט Brillant (BV421)). להעשיר עבור תאים אנטיגן מחייב, תאים מודגרת ואז עם חרוזים מצופים אנטי-PE ו- Abs אנטי-APC, וממוינות תא ההפרדה עמודות. השבר תא APC PE+ + נבחר, ויטראז’ים עם מגוון רחב של mAbs ספציפיות עבור סוגים שונים של תאים PBMC לאפשר זיהוי של תאי B, ומתן וכפופים לזרום cytometry מיון תא. בתאי B שהן PE+ , APC+, אבל–, ויולט מבריק מבודדים. שלב זה נגד בוחר תאים אשר אינם תאים B או אפשרות לאגד אנטיגן tetramerized, אך לאגד PE או APC (תאים אלו יהיו PE+ APC– או PE– APC+) או לחלק הלא-אנטיגן של tetramers בשימוש (אלה התאים יהיה BV421+). בתאי B לא ספציפי מאוד עבור epitope עניין גם נבחרו נגד בשלב זה (תאים אלה יהיה גם BV421+). לכן, בשיטה זו ניתן לטהר ספציפי מאוד B תאים המבטאים קולטנים B-cell (BCRs) יכול להפלות בין שני אנטיגנים מאוד קרובים. תאים B ספציפיים בודדים נאספים צינורות, שלהם cDNAs Ig מוגבר-PCR (חומצות deoxyribonucleic משלימים) שיכפל והביע על-ידי קו תאים אנושיים כמו המופרש mAbs IgG.
מהווה הוכחה של המושג, מחקר זה מתאר הדור יעיל של mAbs האנושי, אשר מזהה פפטיד שהוצגו על-ידי מחלקה מורכבים histocompatibility הגדולות (MHC-אני) מולקולה, יכול להפלות בין פפטיד זה אחרים פפטידים טעון על אותו MHC-אני אלל. רמת המורכבות של Ag זה אמנם חשוב, שיטה זו מאפשרת (i) תשואה גבוהה שחזור של mAbs Ag ספציפיים; (ii) ייצור mAbs מסוגל להפלות בין שתי Ags קרובים מבחינה מבנית. גישה זו ניתן להרחיב את חוסנו או נגועים המטופלים ללא כל שינוי פרוטוקול, גם כבר בהצלחה הוכרז ב מערכת humanized החולדה9. לפיכך, מחקר זה מתאר בגישה רב תכליתי ויעיל להפקת mAbs אנושית לחלוטין שניתן להשתמש בהם מחקר בסיסי, חיסוני.
Protocol
Representative Results
Discussion
הפרוטוקול המוצע היא שיטה חזקה לדור של mAbs האנושי ישירות מתאי B הספציפיים Ag במחזור הדם. היא משלבת שלושה היבטים חשובים: (i) שימוש tetramer-הקשורים מגנטי העשרה, המאפשרת בידוד שמחוץ תאי B Ag מחייב אפילו נדיר; (ii) אסטרטגיה המגביל המשתמשת שלושה Ag tetramers (שני רלבנטיות, אחד לא רלוונטי) מתויג עם שלושה fluorochr…
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
אנו מודים המתקן Cytometry “CytoCell” (SFR Santé, Biogenouest, נאנט) לקבלת סיוע טכני מומחה. אנו מודים גם כל הצוות של ייצור חלבון רקומביננטי (P2R) ושל ההשפעה פלטפורמות (INSERM 1232, SFR Santé, Biogenouest, נאנט) לתמיכה טכנית שלהם. אנו מודים עמנואל Scotet, ריצ’רד Breathnach להערות בונה על כתב היד. עבודה זו נתמכה כלכלית על ידי הפרויקט IHU-צ’סטי במימון התכנית ממשלת צרפת «Investissements d’Avenir», מנוהל על ידי הצרפתי הלאומי מחקר סוכנות (ANR) (ANR-10-IBHU-005). פרויקט IHU-צ’סטי נתמך גם על ידי נאנט Métropole Région פיי דה לה לואר. עבודה זו מומש בהקשר של התוכנית LabEX IGO הנתמך על-ידי הסוכנות מחקר לאומי באמצעות ההשקעה של התוכנית בעתיד ANR-11-LABX-0016-01.
Materials
| HEK 293A cell line | Thermo Fisher scientific | R70507 | |
| DMEM (1X) Dulbecco's Modified Eagle Medium | Gibco by life technologies | 21969-035 | (+) 4,5g/L D-Glucose 0,11g/L Sodium Pyruvate (-) L-Glutmine |
| RPMI medium1640 (1X) | Gibco by life technologies | 31870-025 | |
| Bovine Serum Albumine (BSA) | PAA | K45-001 | |
| Nutridoma-SP | Roche | 11011375001 | 100X Conc |
| PBS-Phosphate Buffered Saline (10X) pH 7,4 | Ambion | AM9624 | |
| EDTA (Ethylenediaminetetraacetic acid) 0,5M pH=8 | Invitrogen by Life Technologies | 15575-020 | |
| Fetal Bovine serum (FBS) | Dominique Dutscher | S1810-500 | |
| Ficoll – lymphocytes separation medium | EuroBio | CMSMSL01-01 | density 1,0777+/-0,001 |
| streptavidin R-phycoerythrin conjugate | Invitrogen by Life Technologies | S21388 | premiun grade 1mg/ml contains 5mM sodium azide |
| Streptavidin, allophycocyanin conjugate | Invitrogen by thermoFisher scientific | S32362 | 1mg/ml 2mM azide premium grade |
| Brilliant violet 421 streptavidin | Biolegend | 405225 | conc : 0,5mg/ml |
| Anti-PE conjugated magnetic MicroBeads | Miltenyi Biotec | 130-048-801 | |
| Anti-APC conjugated magnetic MicroBeads | Miltenyi Biotec | 130-090-855 | |
| MidiMACs or QuadroMACS separotor | Miltenyi Biotec | 130-042-302/130-090-976 | |
| LS Columns | Miltenyi Biotec | 130-042-401 | |
| CD3 BV510 BD horizon | BD Pharmingen / BD Biosciences | 563109 | Used dilution 1:20 |
| CD19 FITC | BD Pharmingen / BD Biosciences | 345788 | Used dilution 1:20 |
| CD14 PerCPCy5.5 | BD Pharmingen / BD Biosciences | 561116 | Used dilution 1:50 |
| CD16 PerCPCy5.5 | BD Pharmingen / BD Biosciences | 338440 | Used dilution 1:50 |
| 7AAD | BD Pharmingen / BD Biosciences | 51-68981E (559925) | Used dilution 1:1000 |
| FACS ARIA III Cell Sorter Cytometer | BD Biosciences | ||
| 8-strip PCR tubes | Axygen | 321-10-061 | |
| Racks for 96 microtubes | Dominique Dutscher | 45476 | |
| RNAseOUT Ribonuclease Inhibitor (recombinant) | Invitrogen by thermoFisher scientific | 10777-019 | qty:5000U (40U/ul) |
| Distilled Water Dnase/Rnase Free | Gibco | 10977-035 | |
| Oligod(T)18 mRNA Primer | New England BioLabs | S1316S | 5.0 A260unit |
| Random hexamers | Invitrogen by thermoFisher scientific | N8080127 | qty : 50uM, 5nmoles |
| Superscript III Reverse transcriptase | Invitrogen by thermoFisher scientific | 18080-044 | qty : 10000U (200U/ul) |
| GoTaq G2 Flexi DNA polymerase | Promega | M7805 | |
| dNTP Set, Molecular biology grade | Thermo Scientific | R0182 | 4*100umol |
| 5LVH1 | Eurofins | ACAGGTGCCCACT CCCAGGTGCAG |
First round of PCR – Amplification of heavy chains – Outer primers – Forward Prmers |
| 5LVH3 | Eurofins | AAGGTGTCCAGTG TGARGTGCAG |
First round of PCR – Amplification of heavy chains – Outer primers – Forward Prmers |
| 5LVL4_6 | Eurofins | CCCAGATGGGTCC TGTCCCAGGTGCAG |
First round of PCR – Amplification of heavy chains – Outer primers – Forward Prmers |
| 5LVH5 | Eurofins | CAAGGAGTCTGTT CCGAGGTGCAG |
First round of PCR – Amplification of heavy chains – Outer primers – Forward Prmers |
| 3HuIgG_const_anti | Eurofins | TCTTGTCCACCTT GGTGTTGCT |
First round of PCR – Amplification of heavy chains – Outer primers -Reverse primers for human Ig- Bacteria PCR screening |
| 3CuCH1 | Eurofins | GGGAATTCTCACA GGAGACGA |
First round of PCR – Amplification of heavy chains – Outer primers -Reverse primers for human Ig |
| 5AgeIVH1_5_7 | Eurofins | CTGCAACCGGTGTACATTCC GAGGTGCAGCTGGTGCAG |
Second round of PCR – Amplification of heavy chains – Inner primers -Forward primers |
| 5AgeIVH3 | Eurofins | CTGCAACCGGTGTACATTCT GAGGTGCAGCTGGTGGAG |
Second round of PCR – Amplification of heavy chains – Inner primers -Forward primers |
| 5AgeIVH3_23 | Eurofins | CTGCAACCGGTGTACATTCT GAGGTGCAGCTGTTGGAG |
Second round of PCR – Amplification of heavy chains – Inner primers -Forward primers |
| 5AgeIVH4 | Eurofins | CTGCAACCGGTGTACATTCC CAGGTGCAGCTGCAGGAG |
Second round of PCR – Amplification of heavy chains – Inner primers -Forward primers |
| 5AgeIVH4_34 | Eurofins | CTGCAACCGGTGTACATTCC CAGGTGCAGCTACAGCAGTG |
Second round of PCR – Amplification of heavy chains – Inner primers -Forward primers |
| 5AgeIVH1_18 | Eurofins | CTGCAACCGGTGTACATTCC CAGGTTCAGCTGGTGCAG |
Second round of PCR – Amplification of heavy chains – Inner primers -Forward primers |
| 5AgeIVH1_24 | Eurofins | CTGCAACCGGTGTACATTCC CAGGTCCAGCTGGTACAG |
Second round of PCR – Amplification of heavy chains – Inner primers -Forward primers |
| 5AgeIVH3__9_30_33 | Eurofins | CTGCAACCGGTGTACATTCT GAAGTGCAGCTGGTGGAG |
Second round of PCR – Amplification of heavy chains – Inner primers -Forward primers |
| 5AgeIVH6_1 | Eurofins | CTGCAACCGGTGTACATTCC CAGGTACAGCTGCAGCAG |
Second round of PCR – Amplification of heavy chains – Inner primers -Forward primers |
| 3SalIJH1_2_4_5 | Eurofins | TGCGAAGTCGACG CTGAGGAGACGGTGACCAG |
Second round of PCR – Amplification of heavy chains – Inner primers -Reverse primers |
| 3SalIJH3 | Eurofins | TGCGAAGTCGACG CTGAAGAGACGGTGACCATTG |
Second round of PCR – Amplification of heavy chains – Inner primers -Reverse primers |
| 3SalIJH6 | Eurofins | TGCGAAGTCGACG CTGAGGAGACGGTGACCGTG |
Second round of PCR – Amplification of heavy chains – Inner primers -Reverse primers |
| 5'LVk1_2 | Eurofins | ATGAGGSTCCCYG CTCAGCTGCTGG |
First round of PCR – Amplification of light chains k – Outer primers -Forward primers |
| 5'LVk3 | Eurofins | CTCTTCCTCCTGC TACTCTGGCTCCCAG |
First round of PCR – Amplification of light chains k – Outer primers -Forward primers |
| 5'LVk4 | Eurofins | ATTTCTCTGTTGC TCTGGATCTCTG |
First round of PCR – Amplification of light chains k – Outer primers -Forward primers |
| 3'Ck543_566 | Eurofins | GTTTCTCGTAGTC TGCTTTGCTCA |
First round of PCR – Amplification of light chains k – Outer primers -Reverse primers- Bacteria PCR screening |
| 5'AgeIVk1 | Eurofins | CTGCAACCGGTGTACATTCT GACATCCAGATGACCCAGTC |
Second round of PCR – Amplification of light chains k – Inner primers -Forward primers |
| 5'AgeIVk1_9_1–13 | Eurofins | TTGTGCTGCAACCGGTGTAC ATTCAGACATCCAGTTGACCCAGTCT |
Second round of PCR – Amplification of light chains k – Inner primers -Forward primers |
| 5'AgeIVk1D_43_1_8 | Eurofins | CTGCAACCGGTGTACATTGT GCCATCCGGATGACCCAGTC |
Second round of PCR – Amplification of light chains k – Inner primers -Forward primers |
| 5'AgeIVk2 | Eurofins | CTGCAACCGGTGTACATGGG GATATTGTGATGACCCAGAC |
Second round of PCR – Amplification of light chains k – Inner primers -Forward primers |
| 5'AgeIVk2_28_2_30 | Eurofins | CTGCAACCGGTGTACATGGG GATATTGTGATGACTCAGTC |
Second round of PCR – Amplification of light chains k – Inner primers -Forward primers |
| 5'AgeVk3_11_3D_11 | Eurofins | TTGTGCTGCAACCGGTGTAC ATTCAGAAATTGTGTTGACACAGTC |
Second round of PCR – Amplification of light chains k – Inner primers -Forward primers |
| 5'AgeVk3_15_3D_15 | Eurofins | CTGCAACCGGTGTACATTCA GAAATAGTGATGACGCAGTC |
Second round of PCR – Amplification of light chains k – Inner primers -Forward primers |
| 5'AgeVk3_20_3D_20 | Eurofins | TTGTGCTGCAACCGGTGTAC ATTCAGAAATTGTGTTGACGCAGTCT |
Second round of PCR – Amplification of light chains k – Inner primers -Forward primers |
| 5'AgeVk4_1 | Eurofins | CTGCAACCGGTGTACATTCG GACATCGTGATGACCCAGTC |
Second round of PCR – Amplification of light chains k – Inner primers -Forward primers |
| 3'BsiWIJk1_2_4 | Eurofins | GCCACCGTACGTT TGATYTCCACCTTGGTC |
Second round of PCR – Amplification of light chains k – Inner primers -Forward primers |
| 3'BsiWIJk3 | Eurofins | GCCACCGTACGTT TGATATCCACTTTGGTC |
Second round of PCR – Amplification of light chains k – Inner primers -Forward primers |
| 3'BsiWIJk5 | Eurofins | GCCACCGTACGTT TAATCTCCAGTCGTGTC |
Second round of PCR – Amplification of light chains k – Inner primers -Forward primers |
| 5'LVl1 | Eurofins | GGTCCTGGGCCCA GTCTGTGCTG |
First round of PCR – Amplification of light chains λ – Outer primers -Forward primers |
| 5'LVl2 | Eurofins | GGTCCTGGGCCCA GTCTGCCCTG |
First round of PCR – Amplification of light chains λ – Outer primers -Forward primers |
| 5'LVl3 | Eurofins | GCTCTGTGACCTC CTATGAGCTG |
First round of PCR – Amplification of light chains λ – Outer primers -Forward primers |
| 5'LVl4_5 | Eurofins | GGTCTCTCTCSCA GCYTGTGCTG |
First round of PCR – Amplification of light chains λ – Outer primers -Forward primers |
| 5'LVl6 | Eurofins | GTTCTTGGGCCAA TTTTATGCTG |
First round of PCR – Amplification of light chains λ – Outer primers -Forward primers |
| 5'LVl7 | Eurofins | GGTCCAATTCYCA GGCTGTGGTG |
First round of PCR – Amplification of light chains λ – Outer primers -Forward primers |
| 5LVl8 | Eurofins | GAGTGGATTCTCA GACTGTGGTG |
First round of PCR – Amplification of light chains λ – Outer primers -Forward primers |
| 3'Cl | Eurofins | CACCAGTGTGGCC TTGTTGGCTTG |
First round of PCR – Amplification of light chains λ – Outer primers -Forward primers |
| 5'AgeIVl1 | Eurofins | CTGCTACCGGTTCCTGGGCC CAGTCTGTGCTGACKCAG |
Second round of PCR – Amplification of light chains λ – Inner primers -forward primers |
| 5'AgeIVl2 | Eurofins | CTGCTACCGGTTCCTGGGCC CAGTCTGCCCTGACTCAG |
Second round of PCR – Amplification of light chains λ – Inner primers -forward primers |
| 5'AgeIVl3 | Eurofins | CTGCTACCGGTTCTGTGACC TCCTATGAGCTGACWCAG |
Second round of PCR – Amplification of light chains λ – Inner primers -forward primers |
| 5'AgeIVl4_5 | Eurofins | CTGCTACCGGTTCTCTCTCS CAGCYTGTGCTGACTCA |
Second round of PCR – Amplification of light chains λ – Inner primers -forward primers |
| 5'AgeIVl6 | Eurofins | CTGCTACCGGTTCTTGGGCC AATTTTATGCTGACTCAG |
Second round of PCR – Amplification of light chains λ – Inner primers -forward primers |
| 5'AgeIVl8 | Eurofins | CTGCTACCGGTTCCAATTCY CAGRCTGTGGTGACYCAG |
Second round of PCR – Amplification of light chains λ – Inner primers -forward primers |
| 3'XhoICl | Eurofins | CTCCTCACTCGAG GGYGGGAACAGAGTG |
Second round of PCR – Amplification of light chains λ – Inner primers -Reverse primers – Bacteria PCR screening |
| Ab-vec-sense | Eurofins | GCTTCGTTAGAAC GCGGCTAC |
Bacteria PCR screening |
| QA Agarose-TM, Molecular Biology Grade | MP Bio | AGAH0500 | |
| NucleoFast 96 PCR Plate | Macherey Nagel | 743.100.100 | |
| Enzyme Age I HF | New England Biolabs | R3552L | 20000U/ml |
| Enzyme SalI HF | New England Biolabs | R3138L | 20000U/ml |
| Enzyme Xho I | New England Biolabs | R0146L | 20000U/ml |
| Enzyme BSIWI | New England Biolabs | R0553L | 10000U/ml |
| HCg1 (Genbank accession number FJ475055) | |||
| LCk (Genbank accession number FJ475056 ) | |||
| LCl (Genbank accession number FJ517647) | |||
| T4 DNA ligase | Invitrogen by thermoFisher scientific | 15224.017 | 100U (1U/ul) |
| 2X YT medium | Sigma Aldrich | Y1003-500ML | |
| Ampicillin | Sigma Aldrich | 10835242001 | |
| LB (Luria Bertani) Broth (Lennox) | Sigma Aldrich | L3022-250G | |
| Nucleospin Plasmid DNA, RNA and protein purification | Macherey Nagel | 740588.250 | |
| Jet PEI DNA transfection reagent | PolyPlus | 101-40 | |
| Flat bottom96-well plate | Falcon | 353072 | |
| V-bottom 96-well plate | Nunc/Thermofisher | 055142 | |
| Nunc easy 175 cm2 flasks | Nunc/Thermofisher | 12-562-000 | |
| ELISA/ELISPOT coating buffer | eBiosciences | 00-0044-59 | |
| Nunc maxisorp flat bottom 96 well ELISA plates | Nunc/Thermofisher | 44-2404-21 | high protein binding |
| Anti-human IgG Ab conjugated to horseradish peroxidase (HRP) | BD Pharmingen / BD Biosciences | 55788 | |
| TMB substrate | BD Biosciences | 555214 | |
| Streptavidin | Sigma | S0677 | |
| 1 mL-HiTrap protein A HP column | GE Healthcare | 17-0402-01 | |
| ÄKTA FPLC | GE Healthcare | 18190026 | |
| Superdex 200 10/300 GL column | GE Healthcare | 17517501 | |
| NGC Quest 10 Plus Chromatography System | BioRad | 7880003 |
References
- Buss, N. A., Henderson, S. J., McFarlane, M., Shenton, J. M., de Haan, L. Monoclonal antibody therapeutics: history and future. Curr Opin Pharmacol. 12 (5), 615-622 (2012).
- Park, J., Kwon, M., Shin, E. C. Immune checkpoint inhibitors for cancer treatment. Arch Pharm Res. 39 (11), 1577-1587 (2016).
- Pendley, C., Schantz, A., Wagner, C. Immunogenicity of therapeutic monoclonal antibodies. Curr Opin Mol Ther. 5 (2), 172-179 (2003).
- Kwakkenbos, M. J., et al. Generation of stable monoclonal antibody-producing B cell receptor-positive human memory B cells by genetic programming. Nat Med. 16 (1), 123-128 (2010).
- Tiller, T., et al. Efficient generation of monoclonal antibodies from single human B cells by single cell RT-PCR and expression vector cloning. J Immunol Methods. 329 (1-2), 112-124 (2008).
- Franz, B., May, K. F., Dranoff, G., Wucherpfennig, K. Ex vivo characterization and isolation of rare memory B cells with antigen tetramers. Blood. 118 (2), 348-357 (2011).
- Morris, L., et al. Isolation of a human anti-HIV gp41 membrane proximal region neutralizing antibody by antigen-specific single B cell sorting. PLoS One. 6 (9), e23532 (2011).
- Iizuka, A., et al. Identification of cytomegalovirus (CMV)pp65 antigen-specific human monoclonal antibodies using single B cell-based antibody gene cloning from melanoma patients. Immunol Lett. 135 (1-2), 64-73 (2011).
- Ouisse, L. H., et al. Antigen-specific single B cell sorting and expression-cloning from immunoglobulin humanized rats: a rapid and versatile method for the generation of high affinity and discriminative human monoclonal antibodies. BMC Biotechnol. 17 (1), 3 (2017).
- Kerkman, P. F., et al. Identification and characterisation of citrullinated antigen-specific B cells in peripheral blood of patients with rheumatoid arthritis. Ann Rheum Dis. , (2015).
- Hamilton, J. A., et al. General Approach for Tetramer-Based Identification of Autoantigen-Reactive B Cells: Characterization of La- and snRNP-Reactive B Cells in Autoimmune BXD2 Mice. J Immunol. 194 (10), 5022-5034 (2015).
- Sanjuan Nandin, I., et al. Novel in vitro booster vaccination to rapidly generate antigen-specific human monoclonal antibodies. J Exp Med. , (2017).
- Bowers, P. M., et al. Mammalian cell display for the discovery and optimization of antibody therapeutics. Methods. 65 (1), 44-56 (2014).
