الرنين المغناطيسي الطيفي للعيش ذبابة الفاكهة السوداء البطن غزل باستخدام زاوية ماجيك
Summary
هذه التقنية تتيح استخدام السحر زاوية عالية الدقة الغزل بروتون MR الطيفي (HRMAS 1H – MRS) لتوصيف الجزيئي للعيش<em> ذبابة الفاكهة السوداء البطن</em> مع مطياف التقليدية تسلا 14.1 مجهزة HRMAS التحقيق.
Abstract
عالية الدقة ماجيك زاوية الغزل (HRMAS) بروتون التحليل الطيفي بالرنين المغناطيسي (<sup> 1</sup> H – MRS) هي رواية غير المدمرة تقنية الذي يحسن الخط الطيفي ويسمح بعرض عالية الدقة الأطياف التي يمكن الحصول عليها من مقتطفات ، وخلايا سليمة والثقافات الخلية ، والأنسجة سليمة أكثر أهمية للتحقيق في العلاقات بين والعمليات الأيضية الخلوية.<em> في الجسم الحي</em> HRMAS<sup> 1</sup> H – MRS الدراسات حتى الآن لم يتم الإبلاغ في ذبابة الفاكهة العيش<em> ذبابة الفاكهة السوداء البطن.</em><em> ذبابة الفاكهة ،</em> كما كائن أبسط الوراثية ، ويسمح للفحص وظائف متعددة البيولوجي ومختلف مسارات إشارات الحفاظ تطويريا على مستوى الحي كله وانها نموذجا مفيدا للتحقيق في علم الوراثة والفيزيولوجيا. تحقيقا لهذه الغاية ، قمنا بتطوير ونفذت<em> في الجسم الحي</em> HRMAS<sup> 1</sup> H – MRS طريقة لتحقيق العيش<em> ذبابة الفاكهة</em> 14،1 في T. هنا ، ونحن الملامح الأساسية لHRMAS<sup> 1</sup> H – MRS بروتوكول لالتوصيف الجزيئي لل<em> ذبابة الفاكهة</em> مع مطياف MR تقليدية مجهزة HRMAS التحقيق. هذا الأسلوب هو الرواية ،<em> في الجسم الحي ،</em> غير مدمرة<em> ذبابة الفاكهة</emقد> نهج القياس المستقلب ، التي تتيح تحديد المؤشرات الحيوية المرض ، وبالتالي المساهمة في التنمية العلاجية الرواية.
Protocol
Discussion
مع استثناء من التقرير الأخير للجدوى في التصوير بالرنين المغناطيسي المجراة في ذبابة الفاكهة 6 ، في الدراسات المجراة في ذبابة الفاكهة MRS لم يتم الإبلاغ عنها. في هذا البروتوكول ، ونحن تصف تنفيذ رواية في HRMAS فيفو نهج H – 1 MRS للكشف عن …
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
وأيد هذا العمل في جزء من المعاهد الوطنية للصحة (NIH) منحة لورانس G. AI063433 رحمة ، معهد المعاهد الوطنية للصحة (NIH) مركز غرانت (P50GM021700) لرونالد تومبكينس G. (A. الأغنية Tzika ، مدير جوهر الرنين المغناطيسي) ، ومستشفى للأطفال في Shriner منحة بحثية (# 8893) إلى ألف الأغنية Tzika. نشكر Dionyssios Mintzopoulos دكتوراه للحصول على المساعدة في المراحل الأولى من تطوير هذا البروتوكول وأوفيديو جيم دكتوراه Andronesi للحصول على المساعدة مع تسلسل نبض TOBSY.
Materials
| Material Name | Type | Company | Catalogue Number | Comment |
|---|---|---|---|---|
| Deuterium oxide | Reagent | Sigma-Aldrich | 7789-20-0 | |
| 3-(trimethylsilyl)propionic-2,2,3,3-d4 acid | Reagent | Sigma-Aldrich | 24493-21-8 | |
| agar, sucrose, yeast, cornmeal | Food | Genesee Scientific Corporation | http://www.flystuff.com/ | |
| Oregon RS or Canton-S flies | Adult fly lines | Bloomington Stock Center | http://flystocks.bio.indiana.edu/ | |
| Paintbrush | Equipment | (size 0) | ||
| 2ml tubes | Equipment | Fisher Scientific | K749521-1590 | |
| Fly incubators | Equipment | high humidity capacity (60-75%), adjustable temperature, and a 12 h:12 h light: dark cycle. | ||
| Bruker Bio-Spin Avance NMR spectrometer (600.13 MHz) 4mm triple resonance (1H, 13C, 2H) HRMAS probe | Equipment | Bruker Bio-Spin | ||
| BTO-2000 unit in combination with a MAS pneumatic unit | Equipment | Bruker Bio-Spin | ||
| 4mm zirconium oxide rotor (capacity 50 ul) | Equipment | Bruker Bio-Spin | B3829 (Bruker store) | |
| MestReC (Mestrelab Research) | Software | 1D NMR spectra analysis http://mestrelab.com/ |
||
| SPARKY 3, USCF | Software | 2D NMR spectra
analysis
http://www.cgl.ucsf.edu/home/sparky/ |
References
- Apidianakis, Y., Rahme, L. G. Drosophila melanogaster as a model host for studying Pseudomonas aeruginosa infection. Nat Protoc. 4, 1285-1294 (2009).
- Meiboom, S., Gill, D. Modified spin-echo method for measuring nuclear relaxation time. Rev Sci Instrum. 29, 688-691 (1958).
- Andronesi, O. C., Mintzopoulos, D., Struppe, J., Black, P. M., Tzika, A. A. Solid-state NMR adiabatic TOBSY sequences provide enhanced sensitivity for multidimensional high-resolution magic-angle-spinning 1H MR spectroscopy. J Magn Reson. 193, 251-258 (2008).
- Astrakas, L. G. Proton NMR spectroscopy shows lipids accumulate in skeletal muscle in response to burn trauma-induced apoptosis. Faseb J. 19, 1431-1440 (2005).
- Fan, T. W. M. Metabolite profiling by one- and two dimensional NMR analysis of complex mixtures. Prog Nuc Magn Reson Spec. 28, 161-219 (1996).
- Null, B., Liu, C. W., Hedehus, M., Conolly, S., Davis, R. W. High-resolution, in vivo magnetic resonance imaging of Drosophila at 18.8 Tesla. PLoS One. 3, e2817-e2817 (2008).
- Zektzer, A. S. Improved signal to noise in high-resolution magic angle spinning total correlation spectroscopy studies of prostate tissues using rotor-synchronized adiabatic pulses. Magn Reson Med. 53, 41-48 (2005).
