Den nuværende protokol beskriver højopløsnings kryo-elektrontomografi fjerndataindsamling ved hjælp af Tomo5 og efterfølgende databehandling og subtomogram gennemsnit ved hjælp af emClarity. Apoferritin bruges som et eksempel til at illustrere detaljerede trin-for-trin processer for at opnå en cryo-ET-struktur ved 2,86 Å opløsning.