Vi tillhandahåller ett detaljerat protokoll för en ubiquitylationsanalys av ett specifikt substrat och en E3 ubiquitin-ligas i däggdjursceller. HEK293T-cellinjer användes för proteinöveruttryck, det polyubiquitylerade substratet renades från celllysater genom immunoprecipitation och löstes i SDS-PAGE. Immunoblotting användes för att visualisera denna post-translationella modifiering.