Journal
/
유전학
/
הרכבה הגנום ההיברידית דה נובו לייצור גנומים שלמים של חיידקי השתן באמצעות טכנולוגיות רצף קצרות וארוכות
JoVE 신문
유전학
This content is Free Access.
JoVE 신문 유전학
Hybrid De Novo Genome Assembly for the Generation of Complete Genomes of Urinary Bacteria using Short- and Long-read Sequencing Technologies
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

הרכבה הגנום ההיברידית דה נובו לייצור גנומים שלמים של חיידקי השתן באמצעות טכנולוגיות רצף קצרות וארוכות

4,457 Views

•

12:08 min

•

August 20, 2021

DOI:

10.3791/62872-v

DOI:
10.3791/62872-v

•

12:08 min
August 20, 2021

•

39 Views
, , , , ,
1Department of Biological Sciences,University of Texas at Dallas, 2Department of Urology,University of Texas Southwestern Medical Center

Summary

Automatically generated

פרוטוקול זה מפרט גישה מקיפה עבור כתות, רצף, ואת הרכב הגנום ההיברידי דה נובו של חיידקי השתן. הוא מספק הליך לשחזור ליצירת רצפי גנום מעגליים שלמים שימושיים בחקר יסודות גנטיים כרומוזומליים ואקסטרכרומוזומליים התורמים לקולוניזציה של שתן, פתוגנזה והפצת התנגדות מיקרוביאלית.

Explore More Videos

Hybrid Genome AssemblyUrinary BacteriaShort-read SequencingLong-read SequencingComplete GenomesGenome ArchitectureMobile Genetic ElementsCulturable BacteriaGenome ContentAdapter LigationFlow Cell PrimingDNA Library PreparationSequencing Run

Read Article

Cite this Article

Sharon, B. M., Hulyalkar, N. V., Nguyen, V. H., Zimmern, P. E., Palmer, K. L., De Nisco, N. J. Hybrid De Novo Genome Assembly for the Generation of Complete Genomes of Urinary Bacteria using Short- and Long-read Sequencing Technologies. J. Vis. Exp. (174), e62872, doi:10.3791/62872 (2021).

Download .ris file

Copy

Share Video

.

Copy