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使用短读和长读测序技术生成尿细菌完整基因组的杂交从 头 基因组组装
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August 20, 2021
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该协议详细介绍了尿细菌培养，测序和 从头 杂交基因组组装的综合方法。它为生成完整的圆形基因组序列提供了一种可重复的程序，可用于研究有助于尿定植、发病机制和抗菌素耐药性传播的染色体和染色体外遗传元件。
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Sharon, B. M., Hulyalkar, N. V., Nguyen, V. H., Zimmern, P. E., Palmer, K. L., De Nisco, N. J. Hybrid De Novo Genome Assembly for the Generation of Complete Genomes of Urinary Bacteria using Short- and Long-read Sequencing Technologies. J. Vis. Exp. (174), e62872, doi:10.3791/62872 (2021).
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