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면역학 및 감염병학
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Adaptación de organoides gastrointestinales para la infección por patógenos y la secuenciación de células individuales en condiciones de nivel de bioseguridad 3 (BSL-3)
JoVE 신문
면역학 및 감염병학
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JoVE 신문 면역학 및 감염병학
Adapting Gastrointestinal Organoids for Pathogen Infection and Single Cell Sequencing under Biosafety Level 3 (BSL-3) Conditions
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Adaptación de organoides gastrointestinales para la infección por patógenos y la secuenciación de células individuales en condiciones de nivel de bioseguridad 3 (BSL-3)

DOI:
10.3791/62857-v

•

07:59 min

•

September 10, 2021

•

,
1Department of Infectious Diseases, Molecular Virology,Heidelberg University Hospital, 2Department of Molecular Genetics and Microbiology, College of Medicine,University of Florida, Gainesville, 3Department of Infectious Diseases, Virology,Heidelberg University Hospital, 4Research Group “Cellular Polarity and Viral Infection”,German Cancer Research Center (DKFZ)

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:04Preparation of Single-Cell Solution and Preparation of Gel Beads-in-Emulsion Under Biosafety Level 3 Conditions
  • 05:47Results: Characterization of Host/Pathogen Interactions at a Single-Cell Level Using scRNAseq Technology
  • 07:11Conclusion

Summary

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Este protocolo describe cómo infectar organoides intestinales humanos desde su lado apical o basolateral para caracterizar las interacciones huésped/patógeno a nivel de una sola célula utilizando la tecnología de secuenciación de ARN de una sola célula (scRNAseq).

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Keywords: Gastrointestinal OrganoidsPathogen InfectionSingle Cell SequencingBiosafety Level 3Viral InfectionIntestinal EpitheliumDifferentiated OrganoidsExtracellular MatrixDissociation EnzymeSingle Cell RNA Sequencing

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