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면역학 및 감염병학
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Adattamento degli organoidi gastrointestinali per l'infezione da agenti patogeni e il sequenziamento di singole cellule in condizioni di livello di biosicurezza 3 (BSL-3)
JoVE 신문
면역학 및 감염병학
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JoVE 신문 면역학 및 감염병학
Adapting Gastrointestinal Organoids for Pathogen Infection and Single Cell Sequencing under Biosafety Level 3 (BSL-3) Conditions
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Adattamento degli organoidi gastrointestinali per l'infezione da agenti patogeni e il sequenziamento di singole cellule in condizioni di livello di biosicurezza 3 (BSL-3)

DOI:
10.3791/62857-v

•

07:59 min

•

September 10, 2021

•

,
1Department of Infectious Diseases, Molecular Virology,Heidelberg University Hospital, 2Department of Molecular Genetics and Microbiology, College of Medicine,University of Florida, Gainesville, 3Department of Infectious Diseases, Virology,Heidelberg University Hospital, 4Research Group “Cellular Polarity and Viral Infection”,German Cancer Research Center (DKFZ)

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:04Preparation of Single-Cell Solution and Preparation of Gel Beads-in-Emulsion Under Biosafety Level 3 Conditions
  • 05:47Results: Characterization of Host/Pathogen Interactions at a Single-Cell Level Using scRNAseq Technology
  • 07:11Conclusion

Summary

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Questo protocollo descrive come infettare gli organoidi intestinali umani dal loro lato apicale o basolaterale per caratterizzare le interazioni ospite/patogeno a livello di singola cellula utilizzando la tecnologia di sequenziamento dell'RNA a singola cellula (scRNAseq).

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Keywords: Gastrointestinal OrganoidsPathogen InfectionSingle Cell SequencingBiosafety Level 3Viral InfectionIntestinal EpitheliumDifferentiated OrganoidsExtracellular MatrixDissociation EnzymeSingle Cell RNA Sequencing

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