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Mineração de genoma guiada por espectrometria em massa como ferramenta para descobrir novos produtos naturais
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JoVE 신문 화학
Mass Spectrometry-Guided Genome Mining as a Tool to Uncover Novel Natural Products

Mineração de genoma guiada por espectrometria em massa como ferramenta para descobrir novos produtos naturais

DOI:
10.3791/60825-v

•

11:13 min

•

March 12, 2020

•

, , ,
1Department of Organic Chemistry, Institute of Chemistry,University of Campinas (UNICAMP), 2Center for Natural and Human Sciences,Federal University of ABC (UFABC)

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 02:54Genome Mining for Biosynthetic Gene Clusters
  • 03:46Strain Cultivation
  • 04:51Acquiring Mass Spectra and Preparation for GNPS Analysis
  • 05:43GNPS Analysis
  • 08:33Results: Genome Sequence Analysis and Molecular Networking
  • 09:46Conclusion

Summary

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Um protocolo de mineração de genoma guiado por espectrometria em massa é estabelecido e descrito aqui. Baseia-se em informações de seqüência de genomas e análise sustal e tem como objetivo facilitar a identificação de moléculas de extratos microbianos e vegetais complexos.

Tags

Mass SpectrometryGenome MiningNatural Product DiscoveryMolecular NetworkingWhole Genome SequencingGenotype-to-chemotypeBiosynthetic ClustersSecondary MetabolismGNPSStreptomycesFungiPlants

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