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새로운 천연 제품을 발견하는 도구로 질량 분광법 유도 게놈 채굴
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JoVE 신문 화학
Mass Spectrometry-Guided Genome Mining as a Tool to Uncover Novel Natural Products
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새로운 천연 제품을 발견하는 도구로 질량 분광법 유도 게놈 채굴

DOI:
10.3791/60825-v

•

11:13 min

•

March 12, 2020

•

, , ,
1Department of Organic Chemistry, Institute of Chemistry,University of Campinas (UNICAMP), 2Center for Natural and Human Sciences,Federal University of ABC (UFABC)

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 02:54Genome Mining for Biosynthetic Gene Clusters
  • 03:46Strain Cultivation
  • 04:51Acquiring Mass Spectra and Preparation for GNPS Analysis
  • 05:43GNPS Analysis
  • 08:33Results: Genome Sequence Analysis and Molecular Networking
  • 09:46Conclusion

Summary

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질량 분광법 유도 게놈 마이닝 프로토콜이 확립되고 여기에 설명되어 있습니다. 그것은 게놈 순서 정보 및 LC-MS/MS 분석을 기반으로 하고 복잡한 미생물 및 식물 추출물에서 분자의 식별을 용이하게 하는 것을 목표로 합니다.

Tags

Mass SpectrometryGenome MiningNatural Product DiscoveryMolecular NetworkingWhole Genome SequencingGenotype-to-chemotypeBiosynthetic ClustersSecondary MetabolismGNPSStreptomycesFungiPlants

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