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新しい天然物を発見するためのツールとしての質量分析誘導ゲノムマイニング
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화학
Mass Spectrometry-Guided Genome Mining as a Tool to Uncover Novel Natural Products
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新しい天然物を発見するためのツールとしての質量分析誘導ゲノムマイニング
DOI:
10.3791/60825-v
•
11:13 min
•
March 12, 2020
•
Renata Sigrist
,
Bruno S. Paulo
,
Célio F. F. Angolini
,
Luciana G. De Oliveira
1
Department of Organic Chemistry, Institute of Chemistry
,
University of Campinas (UNICAMP)
,
2
Center for Natural and Human Sciences
,
Federal University of ABC (UFABC)
Chapters
00:04
Introduction
02:54
Genome Mining for Biosynthetic Gene Clusters
03:46
Strain Cultivation
04:51
Acquiring Mass Spectra and Preparation for GNPS Analysis
05:43
GNPS Analysis
08:33
Results: Genome Sequence Analysis and Molecular Networking
09:46
Conclusion
Summary
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質量分析誘導ゲノムマイニングプロトコルが確立され、ここに記載されています。ゲノム配列情報とLC-MS/MS解析に基づき、複雑な微生物や植物抽出物からの分子の同定を容易にすることを目的としています。
Tags
Mass Spectrometry
Genome Mining
Natural Product Discovery
Molecular Networking
Whole Genome Sequencing
Genotype-to-chemotype
Biosynthetic Clusters
Secondary Metabolism
GNPS
Streptomyces
Fungi
Plants
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