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Proteomica di Top-down su larga scala usando la spettrometria totale in Tandem elettroforesi capillare zona
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Large-scale Top-down Proteomics Using Capillary Zone Electrophoresis Tandem Mass Spectrometry
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Proteomica di Top-down su larga scala usando la spettrometria totale in Tandem elettroforesi capillare zona

DOI:
10.3791/58644-v

•

10:05 min

•

October 24, 2018

•

, , , , ,
1Department of Chemistry,Michigan State University, 2Department of BioHealth Informatics,Indiana University-Purdue University Indianapolis, 3Center for Computational Biology and Bioinformatics,Indiana University School of Medicine

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:27Etching of the Capillary with Hydrofluoric Acid
  • 02:04Set-up of the CZE-MS/MS System and Analysis of the Samples
  • 06:45Database Search of the Collected Raw Files with the TopPIC Software
  • 08:05Results: Identification and Characterization of Proteoforms
  • 09:14Conclusion

Summary

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Un protocollo dettagliato è descritto per la separazione, identificazione e caratterizzazione di proteoforms nei campioni della proteina mediante capillare zonale elettroforesi-electrospray ionizzazione-spettrometria di massa (CZE-ESI-MS/MS). Il protocollo può essere utilizzato per la caratterizzazione ad alta risoluzione di proteoforms nei campioni della proteina semplice e l'identificazione su grande scala di proteoforms in campioni complessi proteoma.

Tags

ProteomicsCapillary Zone ElectrophoresisMass SpectrometryProtein IsoformsProtein Post-translational ModificationsSample PreparationCapillary CoatingCapillary EtchingCZE System Setup

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