Generation of Genome-wide Chromatin Conformation Capture Libraries from Tightly Staged Early <em>Drosophila</em> Embryos

Clemens B. Hug; Juan M. Vaquerizas

doi:10.3791/57001

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Geração de todo o genoma da cromatina conformação captura bibliotecas de firmemente encenado embriões adiantados da drosófila

JoVE 신문
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Generation of Genome-wide Chromatin Conformation Capture Libraries from Tightly Staged Early Drosophila Embryos

Geração de todo o genoma da cromatina conformação captura bibliotecas de firmemente encenado embriões adiantados da drosófila

DOI:

10.3791/57001-v

•

10:35 min

•

October 03, 2018

•

Clemens B. Hug, Juan M. Vaquerizas

¹Max Planck Institute for Molecular Biomedicine

Chapters

00:04Title
00:37Embryo Fixation
01:48Embryo Sorting
03:07In Situ Hi-C – Lysis
04:57In Situ Hi-C – Digestion, Overhang Fill-in, and Ligation
06:58DNA Extraction
09:11Results: Analysis of Chromatin Conformation Capture Libraries from Drosophila Embryos
09:58Conclusion

Summary

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Este trabalho descreve um protocolo para a geração de alta resolução em situ Hi-C bibliotecas de encenado firmemente pre-gastrulação Drosophila melanogaster embriões.

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Determinação do genoma de sincronismo Replication Mammalian por DNA Medição conteúdo

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Mapeamento de genoma-larga acessível cromatina em linfócitos T humana primária pela ATAC-Seq

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Mediada por CRISPR reorganização da estrutura de Loop de cromatina

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