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멀티 플렉스 RT-qPCR에 사용 단일 세포 유전자 발현은 희귀 림프 인구의 이질성의 특성을
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JoVE 신문 유전학
Single-cell Gene Expression Using Multiplex RT-qPCR to Characterize Heterogeneity of Rare Lymphoid Populations
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멀티 플렉스 RT-qPCR에 사용 단일 세포 유전자 발현은 희귀 림프 인구의 이질성의 특성을

DOI:
10.3791/54858-v

•

10:23 min

•

January 19, 2017

•

, , , ,
1Unit for Lymphopoieseis, Immunology Department, INSERM U1223, University Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Cellule Pasteur,Institut Pasteur, 2Center for Translational Science,Institut Pasteur, INSERM UMS20

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:40Preparing a 96-well Single-cell Sorting Plate
  • 01:55Single-cell Fluorescence-activated Cell Sorting (FACS)
  • 03:02Pre-amplification
  • 03:38Preparing a 96-well Sample Plate
  • 04:23Preparing a 96-well Assay Plate
  • 04:51Preparing and Running the Single-cell Gene-expression Chip
  • 06:52Data Analysis
  • 08:04Results: Single-cell Multiplex RT-qPCR Identifies Cell Heterogeneity of the Liver ILC Compartment
  • 09:33Conclusion

Summary

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이 프로토콜은 클론 수준에서 유전자의 큰 어레이의 식을 평가하는 방법을 설명한다. 단일 셀 RT-qPCR에 샘플과 유전자의 수백에 대한 강한 감도와 신뢰성이 높은 결과를 얻을 수 있습니다.

Tags

Single-cell Gene ExpressionMultiplex RT-qPCRHeterogeneityRare Lymphoid PopulationsPre-amplificationAssay MixFACSInnate Lymphoid CellsNo-input ControlCDNA DilutionReverse TranscriptionPre-amplification

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