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レアリンパ集団の不均一性を特徴づけるためにマルチプレックスRT-qPCRのを使用した単一細胞の遺伝子発現
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JoVE 신문 유전학
Single-cell Gene Expression Using Multiplex RT-qPCR to Characterize Heterogeneity of Rare Lymphoid Populations
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レアリンパ集団の不均一性を特徴づけるためにマルチプレックスRT-qPCRのを使用した単一細胞の遺伝子発現

DOI:
10.3791/54858-v

•

10:23 min

•

January 19, 2017

•

, , , ,
1Unit for Lymphopoieseis, Immunology Department, INSERM U1223, University Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Cellule Pasteur,Institut Pasteur, 2Center for Translational Science,Institut Pasteur, INSERM UMS20

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:40Preparing a 96-well Single-cell Sorting Plate
  • 01:55Single-cell Fluorescence-activated Cell Sorting (FACS)
  • 03:02Pre-amplification
  • 03:38Preparing a 96-well Sample Plate
  • 04:23Preparing a 96-well Assay Plate
  • 04:51Preparing and Running the Single-cell Gene-expression Chip
  • 06:52Data Analysis
  • 08:04Results: Single-cell Multiplex RT-qPCR Identifies Cell Heterogeneity of the Liver ILC Compartment
  • 09:33Conclusion

Summary

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このプロトコルは、クローンレベルでの遺伝子の大規模な配列の発現を評価する方法について説明します。単一細胞RT-qPCRをサンプルと数百の遺伝子のための強力な感度を有する信頼性の高い結果が得られます。

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Single-cell Gene ExpressionMultiplex RT-qPCRHeterogeneityRare Lymphoid PopulationsPre-amplificationAssay MixFACSInnate Lymphoid CellsNo-input ControlCDNA DilutionReverse TranscriptionPre-amplification

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