Summary

माउस Neocortex में सेलुलर संगठन के बड़े पैमाने पर तीन आयामी इमेजिंग

Published: September 05, 2018
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Summary

यहाँ हम ऊतक समाशोधन के लिए एक प्रक्रिया का वर्णन, फ्लोरोसेंट लेबलिंग, और माउस मस्तिष्क ऊतक के बड़े पैमाने पर इमेजिंग, जिससे, neocortex में कोशिका प्रकार के तीन आयामी संगठन के दृश्य में सक्षम बनाता है.

Abstract

स्तनधारी neocortex उत्तेजक और निरोधात्मक न्यूरॉन्स के कई प्रकार से बना है, विशिष्ट electrophysiological और जैव रासायनिक गुणों के साथ प्रत्येक, synaptic कनेक्शन, और vivo कार्यों में , लेकिन उनके बुनियादी कार्यात्मक और संरचनात्मक नेटवर्क स्केल करने के लिए सेलुलर से संगठन खराब समझ है । यहाँ हम cortical सेलुलर संगठन की जांच के लिए मस्तिष्क के बड़े क्षेत्रों में फ्लोरोसेंट-लेबल वाले न्यूरॉन्स के तीन आयामी इमेजिंग के लिए एक विधि का वर्णन. न्यूरॉन्स के विशिष्ट प्रकार फ्लोरोसेंट प्रतिगामी न्यूरॉन्स या ट्रांसजेनिक चूहों में फ्लोरोसेंट प्रोटीन की अभिव्यक्ति के इंजेक्शन द्वारा लेबल कर रहे हैं. ब्लॉक मस्तिष्क के नमूनों, जैसे, एक गोलार्द्ध, निर्धारण के बाद तैयार कर रहे हैं, ऊतक समाशोधन तरीकों के साथ पारदर्शी बनाया, और विशिष्ट कोशिका प्रकार के फ्लोरोसेंट immunolabeling के अधीन । बड़े क्षेत्रों फोकल या दो फोटॉन सूक्ष्मदर्शी बड़े काम दूरी उद्देश्यों और मोटर चालित चरणों से सुसज्जित का उपयोग कर स्कैन कर रहे हैं । इस विधि में माउस neocortex कक्ष प्रकार-विशिष्ट microcolumn कार्यशील मॉड्यूल की आवर्ती संगठन को हल कर सकते हैं । प्रक्रिया विविध मस्तिष्क क्षेत्रों और अंय जटिल ऊतकों में तीन आयामी सेलुलर वास्तुकला के अध्ययन के लिए उपयोगी हो सकता है ।

Introduction

स्तनधारी neocortex कोशिका प्रकार की एक बड़ी संख्या से बना है, विशिष्ट जीन अभिव्यक्ति पैटर्न के साथ प्रत्येक, electrophysiological और जैव रासायनिक गुण, synaptic कनेक्शन, और vivo में कार्य करताहै 1,2 ,3,4,5,6,7. क्या इन सेल प्रकार दोहराया संरचनाओं में आयोजित कर रहे है अस्पष्ट है । Cortical कॉलम, दृश्य अभिविंयास कॉलम और somatosensory बैरल सहित, दोहराया संरचनाओं है, लेकिन उनके सेलुलर संगठन अस्पष्ट8,9रहता है । ये विशिष्ट cortical क्षेत्रों में विद्यमान हैं और मस्तिष्क-व्यापी व्यवस्था नहीं हैं.

neocortical परत 5 में, न्यूरॉन्स के बड़े बहुमत चार प्रमुख प्रकार में वर्गीकृत कर रहे हैं. उत्तेजक न्यूरॉन्स की एक प्रमुख प्रकार, उप मस्तिष्क प्रक्षेपण न्यूरॉन्स, pons, रीढ़ की हड्डी, और बेहतर colliculus सहित subcortical लक्ष्यों को axons परियोजनाओं, और, इसलिए, प्रमुख cortical उत्पादन मार्ग10का प्रतिनिधित्व करता है. Cortical प्रोजेक्शन न्यूरॉन्स, उत्तेजक न्यूरॉन्स की एक अन्य प्रमुख प्रकार, अंदर आना प्रांतस्था10. निरोधात्मक न्यूरॉन्स में भी दो प्रमुख वर्ग होते हैं: parvalbumin-एक्सप्रेस और सोमेटोस्टैटिन-एक्सप्रेस कोशिकाओं11.

हाल के विश्लेषणों से संकेत मिलता है कि चार कक्ष प्रकार दोहराया संरचनाओं12,13,14में आयोजित कर रहे हैं । दोनों उप-मस्तिष्क प्रक्षेपण न्यूरॉन्स12,13,14 और cortical प्रक्षेपण न्यूरॉन्स14 कक्ष-प्रकार विशिष्ट microcolumns में 1 – 2 कक्षों का व्यास के साथ व्यवस्थित करें । Parvalbumin-एक्सप्रेस और सोमेटोस्टैटिन-एक्सप्रेस कोशिकाओं विशेष रूप से उप-मस्तिष्क प्रक्षेपण न्यूरॉन्स के microcolumns के साथ नहीं बल्कि cortical प्रक्षेपण न्यूरॉन्स14के microcolumns के साथ संरेखित करें. Microcolumns खुद को समय से एक षट्कोण जाली सरणी फार्म के लिए संरेखित करें और दृश्य, somatosensory, और माउस मस्तिष्क12,14 और भाषा में मोटर क्षेत्रों सहित कई cortical क्षेत्रों में मौजूद हैं मानव मस्तिष्क के क्षेत्रों13. ंयूरॉंस में व्यक्तिगत microcolumn प्रदर्शन सिंक्रनाइज़ गतिविधि और इसी तरह संवेदी प्रतिक्रियाएं14। इन टिप्पणियों का संकेत है कि परत 5 सेल प्रकार एक microcolumn जाली कार्यात्मक मॉड्यूल दोहरा के पहले ज्ञात मस्तिष्क व्यापक संगठन का प्रतिनिधित्व संरचना में संगठित ।

Microcolumns लगभग 10 µm के एक त्रिज्या है और लगभग ४० µm के एक स्थानिक समय-अवधि है । इसके अलावा, microcolumns के उंमुखीकरण उनके शिखर dendrites और परिवर्तन प्रांतस्था14में अपनी स्थिति के आधार पर समानांतर है । इसलिए, microcolumn प्रणाली micrometers के कुछ दसियों की एक ठेठ मोटाई के साथ पारंपरिक cortical स्लाइस का उपयोग कर विश्लेषण करने के लिए मुश्किल है । इसके अलावा, आवधिकता के विश्लेषण मस्तिष्क क्षेत्रों की एक विस्तृत रेंज से तीन आयामी डेटा की आवश्यकता है, और इसलिए, फोकल माइक्रोस्कोपी के ठेठ इमेजिंग क्षेत्र या vivo 2-फोटॉन इमेजिंग में भी संकीर्ण है ।

हाल ही में, तकनीक15,16के घने ऊतकों को स्पष्ट करने के लिए विकसित किया गया है । यहां हम इन तरीकों के आवेदन का वर्णन करने के लिए बड़े पैमाने पर, तीन माउस neocortical 5 परत में प्रमुख कोशिका प्रकार के आयामी चित्र है कि microcolumn प्रणाली शामिल प्राप्त करते हैं । उपमस्तिष्क प्रक्षेपण न्यूरॉन्स प्रतिगामी लेबलिंग द्वारा या Crym-egfp ट्रांसजेनिक चूहों12में बढ़ाया हरी फ्लोरोसेंट प्रोटीन की अभिव्यक्ति द्वारा लेबल कर रहे हैं, और cortical प्रक्षेपण न्यूरॉन्स या तो प्रतिगामी द्वारा लेबल हैं लेबलिंग या Tlx3cre/Ai9 चूहों में tdTomato अभिव्यक्ति द्वारा17. Parvalbumin-एक्सप्रेस और सोमेटोस्टैटिन-एक्सप्रेस कोशिकाओं immunohistochemistry द्वारा लेबल कर रहे हैं । (एंटीबॉडी स्केल S) AbScale विधि18 का प्रयोग एंटीबॉडी दाग-धब्बों के लिए किया जाता है, जबकि (देखें डीप ब्रेन) SeeDB विधि19 का प्रयोग अन्य प्रयोगों के लिए किया जाता है । इन तरीकों पारंपरिक इमेजिंग तरीकों की उपर्युक्त कठिनाइयों को दूर करने और 514परत के सटीक सेलुलर संगठन का पता चलता है ।

Protocol

आरआईकेईएन वको पशु प्रयोग समिति और आरआईकेईएन आनुवंशिक रिकॉमबिनेंट प्रयोग सुरक्षा समिति द्वारा सभी प्रायोगिक प्रक्रियाओं को अनुमोदित किया गया और आरआईकेईएन ब्रेन साइंस की पशु सुविधाओं के संस्थागत द?…

Representative Results

हम Tlx3में tdTomato की अभिव्यक्ति द्वारा cortical प्रक्षेपण ंयूरॉंस लेबल-cre/Ai9 ट्रांसजेनिक चूहों और visualized उप मस्तिष्क प्रक्षेपण न्यूरॉन्स CTB488 में प्रतिगामी अनुरेखक pons इंजेक्शन द्वारा । मस्तिष्क के …

Discussion

हमने माउस neocortical लेयर 5 में प्रमुख कक्ष प्रकार के कक्ष प्रकार-विशिष्ट संगठन के बड़े पैमाने पर तीन-आयामी छवियां प्राप्त करने के लिए कार्यविधियां प्रस्तुत की हैं । पारंपरिक टुकड़ा धुंधला की तुलना में, विधि…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

हम AbScaएलई प्रयोगों पर उनकी सलाह के लिए अतसुशी Miyawaki और हिरोशी हामा का शुक्रिया अदा करते हैं, चार्ल्स Yokoyama पांडुलिपि के संपादन के लिए, Eriko Ohshima और मियुकी Kishino उनकी तकनीकी सहायता के लिए । इस काम के लिए आरआईकेईएन से T.H. और अनुदान में अनुसंधान कोष द्वारा समर्थित था शिक्षा, संस्कृति, खेल, विज्ञान और प्रौद्योगिकी के मंत्रालय से वैज्ञानिक अनुसंधान के लिए सहायता (जापान के MEXT) T.H. (अभिनव क्षेत्रों “Mesoscopic Neurocircuitry”; २२११५००४) और एस॰एस॰ (२५८९००२३) ।

Materials

Crym-egfp transgenic mice MMRRC 012003-UCD
Tlx3-cre transgenic mice MMRRC 36547-UCD
ROSA-CAG-flox-tdTomato mice Jackson Laboratory JAX #7909
Silicone rubber sheet AS ONE 6-611-01 0.5 mm thickness
Silicone rubber sheet AS ONE 6-611-02 1.0 mm thickness
Silicone rubber sheet AS ONE 6-611-05 3.0 mm thickness
Petri dishes Falcon 351008
Cover glass Matsunami C022241
Cholera toxin subunit B (recombinant), Alexa Fluor 488 conjugate Invitrogen C22841
Cholera toxin subunit B (recombinant), Alexa Fluor 555 conjugate Invitrogen C22843
Cholera toxin subunit B (recombinant), Alexa Fluor 594 conjugate Invitrogen C22842
Cholera toxin subunit B (recombinant), Alexa Fluor 647 conjugate Invitrogen C34778
26G Hamilton syringe Hamilton 701N
Injector pump KD Scientific KDS 310 Pons injection
Injector pump KD Scientific KDS 100 Superior colliculus injection
Manipulator Narishige SM-15
Sodium pentobarbital Kyoritsu Seiyaku Somnopentyl
Isoflurane Pfizer
Lidocaine AstraZeneca Xylocaine injection 1% with epinephrine
Drill Toyo Associates HP-200
Avitene microfibrillar hemostat Davol Inc 1010090
Alonalfa Daiichi-Sankyo Alonalpha A
Surgical silk Ethicon K881H
Incubator UVP HB-1000 Hybridizer
Glass pipette Drummond Scientific Company 2-000-075
Electrode puller Sutter Instrument Company P-97
Paraffin Liquid, light Nacalai tesque 26132-35
Saline Otsuka 1326
Paraformaldehyde Nacalai tesque 26126-54
Tungsten needle Inter medical Φ0.1 *L200 mm
Vibratome Leica VT1000S
50 mL plastic tube Falcon 352070
α-thioglycerol Nacalai tesque 33709-62
D(-) Fructose Nacalai tesque 16315-55
BluTack Bostik CKBT-450000
Two-photon microscope Nikon A1RMP
Water-immersion long working distance objectives Nikon CFI Apo LWD 25XW, NA 1.1, WD 2 mm
Water-immersion long working distance objectives Nikon CFI LWD 16XW, NA 0.8, WD 3 mm
Motorized stage COMS PT100C-50XY
Filter Semrock FF01-492/SP-25
Filter Semrock FF03-525/50-25
Filter Semrock FF03-575/25-25
Filter Semrock FF01-629/56
Filter Chroma D605/55m
5 mL plastic tube AS ONE VIO-5B
2 mL plastic tube Eppendorf  0030120094
Urea Nacalai tesque 35905-35
Triton X-100 Nacalai tesque 35501-15
Glyserol Sigma-aldrich 191612
D(-)-sorbitol Wako 191-14735
Methyl-β-cyclodextrin Tokyo chemical industry M1356
γ-Cyclodextrin Wako 037-10643
N-acetyl-L-hydroxyproline Skin Essential Actives 33996-33-7
DMSO Nacalai tesque 13445-45
Bovine Serum Albumin Sigma-aldrich A7906
Tween-20 (1.1 g/mL) Nacalai tesque 35624-15
Goat anti-Mouse IgG (H+L) Cross-Adsorbed Secondary Antibody, Alexa Fluor 555 Invitrogen A21422
Goat anti-Rabbit IgG (H+L) Cross-Adsorbed Secondary Antibody, Alexa Fluor 555 Invitrogen A21428
Goat anti-Mouse IgG (H+L) Cross-Adsorbed Secondary Antibody, Alexa Fluor 647 Invitrogen A21235
Goat anti-Mouse IgG (H+L) Highly CrossAdsorbed Secondary Antibody, Alexa Fluor 488 Invitrogen A11029
Donkey anti-Rabbit IgG (H+L) Highly CrossAdsorbed Secondary Antibody, Alexa Fluor 488 Invitrogen A21206
Confocal microscope Olympus FV1000
Water-immersion long working distance objectives Olympus XLUMPLFLN 20XW, NA 1.0, WD 2 mm
Anti-NeuN Millipore MAB377
Anti-NeuN Millipore ABN78
Anti-CTIP2 Abcam ab18465
Anti-Statb2 Abcam ab51502
Anti-GAD67 Millipore MAB5406
Anti-GABA Sigma A2052
Anti-Parvalbumin Swant 235
Anti-Parvalbumin Frontier Institute PV-Go-Af460
Anti-Parvalbumin Sigma P3088
Anti-Parvalbumin Abcam ab11427
Anti-Somatostatin Peninsula Laboratories T-4103
Anti-c-Fos CalbioChem PC38

References

  1. Lein, E. S., et al. Genome-wide atlas of gene expression in the adult mouse brain. Nature. 445 (7124), 168-176 (2007).
  2. Defelipe, J., et al. New insights into the classification and nomenclature of cortical GABAergic interneurons. Nature Reviews Neuroscience. 14 (3), 202-216 (2013).
  3. Jiang, X., et al. Principles of connectivity among morphologically defined cell types in adult neocortex. Science. 350 (6264), aac9462 (2015).
  4. Sorensen, S. A., et al. Correlated gene expression and target specificity demonstrate excitatory projection neuron diversity. Cerebral Cortex. 25 (2), 433-449 (2015).
  5. Zeisel, A., et al. Brain structure. Cell types in the mouse cortex and hippocampus revealed by single-cell RNA-seq. Science. 347, 1138-1142 (2015).
  6. Tasic, B., et al. Adult mouse cortical cell taxonomy revealed by single cell transcriptomics. Nature Neuroscience. 19 (2), 335-346 (2016).
  7. Zeng, H., Sanes, J. R. Neuronal cell-type classification: Challenges, opportunities and the path forward. Nature Reviews Neuroscience. 18 (9), 530-546 (2017).
  8. Horton, J. C., Adams, D. L. The cortical column: a structure without a function. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 360 (1456), 837-862 (2005).
  9. Costa, N. M., Martin, K. A. C. Whose cortical column would that be?. Frontiers in Neuroanatomy. 4, (2010).
  10. Molyneaux, B. J., Arlotta, P., Menezes, J. R. L., Macklis, J. D. Neuronal subtype specification in the cerebral cortex. Nature Reviews Neuroscience. 8 (6), 427-437 (2007).
  11. Hioki, H., et al. Cell type-specific inhibitory inputs to dendritic and somatic compartments of parvalbumin-expressing neocortical interneuron. Journal of Neuroscience. 33 (2), 544-555 (2013).
  12. Maruoka, H., Kubota, K., Kurokawa, R., Tsuruno, S., Hosoya, T. Periodic organization of a major subtype of pyramidal neurons in neocortical layer V. Journal of Neuroscience. 31 (50), 18522-18542 (2011).
  13. Kwan, K. Y., et al. Species-dependent posttranscriptional regulation of NOS1 by FMRP in the developing cerebral cortex. Cell. 149 (4), 899-911 (2012).
  14. Maruoka, H., Nakagawa, N., Tsuruno, S., Sakai, S., Yoneda, T., Hosoya, T. Lattice system of functionally distinct cell types in the neocortex. Science. 358 (6363), 610-615 (2017).
  15. Treweek, J. B., Gradinaru, V. Extracting structural and functional features of widely distributed biological circuits with single cell resolution via tissue clearing and delivery vectors. Current Opinion in Biotechnology. 40, 193-207 (2016).
  16. Tainaka, K., Kuno, A., Kubota, S. I., Murakami, T., Ueda, H. R. Chemical Principles in Tissue Clearing and Staining Protocols for Whole-Body Cell Profiling. Annual Review of Cell and Developmental Biology. 32 (1), (2016).
  17. Gerfen, C. R., Paletzki, R., Heintz, N. GENSAT BAC cre-recombinase driver lines to study the functional organization of cerebral cortical and basal ganglia circuits. Neuron. 80 (6), 1368-1383 (2013).
  18. Hama, H., et al. ScaleS: an optical clearing palette for biological imaging. Nature Neuroscience. 18 (10), 1518-1529 (2015).
  19. Ke, M. T., Fujimoto, S., Imai, T. SeeDB: a simple and morphology-preserving optical clearing agent for neuronal circuit reconstruction. Nature Neuroscience. 16 (8), 1154-1161 (2013).
  20. Gage, G. J., Kipke, D. R., Shain, W. Whole Animal Perfusion Fixation for Rodents. Journal of Visualized Experiments. (65), e3564 (2012).
  21. Kim, S. -. Y., et al. Stochastic electrotransport selectively enhances the transport of highly electromobile molecules. Proceedings of the National Academy of Sciences. 112 (46), E6274-E6283 (2015).
  22. Murray, E., et al. Simple, scalable proteomic imaging for high-dimensional profiling of intact systems. Cell. 163 (6), 1500-1514 (2015).
  23. Ke, M. T., et al. Super-resolution mapping of neuronal circuitry with an index-optimized clearing agent. Cell Reports. 14 (11), 2718-2732 (2016).
  24. Lee, E., et al. ACT-PRESTO: Rapid and consistent tissue clearing and labeling method for 3-dimensional (3D) imaging. Scientific Reports. 6, 18631 (2016).
  25. Renier, N., et al. Mapping of Brain Activity by Automated Volume Analysis of Immediate Early Genes. Cell. 165 (7), 1789-1802 (2016).
  26. Kubota, S. I., et al. Whole-body profiling of cancer metastasis with single-cell resolution. Cell Reports. 20 (1), 236-250 (2017).
  27. Li, W., Germain, R. N., Gerner, M. Y. Multiplex, quantitative cellular analysis in large tissue volumes with clearing-enhanced 3D microscopy (Ce3D). Proceedings of the National Academy of Sciences. 114 (35), E7321-E7330 (2017).
  28. Liu, A. K. L., Lai, H. M., Chang, R. C. C., Gentleman, S. M. Free of acrylamide sodium dodecyl sulphate (SDS)-based tissue clearing (FASTClear): a novel protocol of tissue clearing for three-dimensional visualization of human brain tissues. Neuropathology and Applied Neurobiology. 43 (4), 346-351 (2017).
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Cite This Article
Yoneda, T., Sakai, S., Maruoka, H., Hosoya, T. Large-scale Three-dimensional Imaging of Cellular Organization in the Mouse Neocortex. J. Vis. Exp. (139), e58027, doi:10.3791/58027 (2018).

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