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Uma abordagem altamente escalável para realizar pesquisas ecológicas de nematodes de caenorhabditis
JoVE Journal
生物学
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JoVE Journal 生物学
A Highly Scalable Approach to Perform Ecological Surveys of Selfing Caenorhabditis Nematodes

Uma abordagem altamente escalável para realizar pesquisas ecológicas de nematodes de caenorhabditis

DOI:
10.3791/63486-v

•

09:10 min

•

March 01, 2022

•

, , , ,
1Department of Molecular Biosciences,Northwestern University

章

  • 00:04Introduction
  • 00:34Collection Preparation
  • 01:21Field Collection
  • 02:21Plating Out Field Collections and Isolating Nematodes from Collections
  • 04:06Exporting S-Plates from Fulcrum
  • 04:41Check for Proliferation on S-Plates
  • 05:26Lysis of Isofemale Lines
  • 06:22PCR of SSU and ITS2 Sequences
  • 07:00Identifying Nematodes and Processing the Collection Data
  • 08:04Results: Identifying Nematodes with Sanger Sequencing and Sequence BLAST
  • 08:40Conclusion

概要

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Este protocolo pode ser usado para realizar levantamentos ecológicos em larga escala de nematodes caenorhabditis autodes . A principal vantagem desse método é a eficiente organização e análise de dados ecológicos e moleculares associados aos nematoides coletados da natureza.

タグ

Caenorhabditis NematodesEcological SurveyMobile Data CollectionCloud-based DatabaseStandardized Data ProcessingSubstrate TemperatureAmbient TemperatureHumidityOP50 BacteriaNematode Isolation

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