ジャーナル
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Un approccio altamente scalabile per eseguire indagini ecologiche sui nematodi della caenorhabdite selfing
JoVE Journal
生物学
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JoVE Journal 生物学
A Highly Scalable Approach to Perform Ecological Surveys of Selfing Caenorhabditis Nematodes

Un approccio altamente scalabile per eseguire indagini ecologiche sui nematodi della caenorhabdite selfing

DOI:

09:10 min

March 01, 2022

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  • 00:04Introduction
  • 00:34Collection Preparation
  • 01:21Field Collection
  • 02:21Plating Out Field Collections and Isolating Nematodes from Collections
  • 04:06Exporting S-Plates from Fulcrum
  • 04:41Check for Proliferation on S-Plates
  • 05:26Lysis of Isofemale Lines
  • 06:22PCR of SSU and ITS2 Sequences
  • 07:00Identifying Nematodes and Processing the Collection Data
  • 08:04Results: Identifying Nematodes with Sanger Sequencing and Sequence BLAST
  • 08:40Conclusion

概要

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Questo protocollo può essere utilizzato per eseguire indagini ecologiche su larga scala dei nematodi Caenorhabditis selfing. Il vantaggio principale di questo metodo è l'organizzazione efficiente e l'analisi dei dati ecologici e molecolari associati ai nematodi raccolti dalla natura.

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