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TACI: 3D カルシウムイメージング解析のための ImageJ プラグイン

Journal JoVE
Neurosciences

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TACI: An ImageJ Plugin for 3D Calcium Imaging Analysis

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TACI: 3D カルシウムイメージング解析のための ImageJ プラグイン

DOI:

10.3791/64953-v

•

09:39 min

•

December 16, 2022

•

Alisa A. Omelchenko², Hua Bai, Sibtain Hussain, Jordan J. Tyrrell³, Mason Klein, Lina Ni

¹School of Neuroscience,Virginia Polytechnic Institute and State University, ²CMU-Pitt Joint Computational Biology, School of Medicine,University of Pittsburgh, ³Eastern Virginia Medical School, ⁴Department of Physics,University of Miami

Chapitres

00:05Introduction
00:33Calcium Imaging
01:38Analysis of 3D Calcium Imaging Data by TACI
07:29Results: Using TACI to Analyze 3D Calcium Imaging
08:48Conclusion

Summary

Traduction automatique

TrackMate カルシウムイメージング分析(TACI)は、z軸の動きを調べ、各zスタックの最大値を特定して、対応する時点での細胞の強度を表す、3Dカルシウムイメージング分析用のオープンソースのImageJプラグインです。横方向(x / y)方向に重なり合うが、異なるz平面上にあるニューロンを分離できます。

Tags

3D Calcium Imaging ImageJ Plugin TACI Motion Correction Z-drift Temperature Recording Peltier TIFF File Renaming TIFF File Organizing

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