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TACI: 3D カルシウムイメージング解析のための ImageJ プラグイン
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TACI: An ImageJ Plugin for 3D Calcium Imaging Analysis
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TACI: 3D カルシウムイメージング解析のための ImageJ プラグイン

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•

09:39 min

•

December 16, 2022

DOI:

10.3791/64953-v

DOI:
10.3791/64953-v

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09:39 min
December 16, 2022

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1School of Neuroscience,Virginia Polytechnic Institute and State University, 2CMU-Pitt Joint Computational Biology, School of Medicine,University of Pittsburgh, 3Eastern Virginia Medical School, 4Department of Physics,University of Miami

Summary

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TrackMate カルシウムイメージング分析(TACI)は、z軸の動きを調べ、各zスタックの最大値を特定して、対応する時点での細胞の強度を表す、3Dカルシウムイメージング分析用のオープンソースのImageJプラグインです。横方向(x / y)方向に重なり合うが、異なるz平面上にあるニューロンを分離できます。

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Omelchenko, A. A., Bai, H., Hussain, S., Tyrrell, J. J., Klein, M., Ni, L. TACI: An ImageJ Plugin for 3D Calcium Imaging Analysis. J. Vis. Exp. (190), e64953, doi:10.3791/64953 (2022).

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