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TACI: Ein ImageJ-Plugin für die 3D-Calcium-Imaging-Analyse
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TACI: An ImageJ Plugin for 3D Calcium Imaging Analysis
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TACI: Ein ImageJ-Plugin für die 3D-Calcium-Imaging-Analyse

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09:39 min

•

December 16, 2022

DOI:

10.3791/64953-v

DOI:
10.3791/64953-v

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09:39 min
December 16, 2022

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1School of Neuroscience,Virginia Polytechnic Institute and State University, 2CMU-Pitt Joint Computational Biology, School of Medicine,University of Pittsburgh, 3Eastern Virginia Medical School, 4Department of Physics,University of Miami

Summary

Automatically generated

TrackMate Analysis of Calcium Imaging (TACI) ist ein Open-Source-ImageJ-Plugin für die 3D-Calcium-Imaging-Analyse, das die Bewegung auf der z-Achse untersucht und den Maximalwert jedes Z-Stapels identifiziert, um die Intensität einer Zelle zum entsprechenden Zeitpunkt darzustellen. Es kann Neuronen trennen, die sich in lateraler (x / y) Richtung, aber auf verschiedenen Z-Ebenen überlappen.

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3D Calcium ImagingImageJ PluginTACIMotion CorrectionZ-driftTemperature RecordingPeltierTIFF File RenamingTIFF File Organizing

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Omelchenko, A. A., Bai, H., Hussain, S., Tyrrell, J. J., Klein, M., Ni, L. TACI: An ImageJ Plugin for 3D Calcium Imaging Analysis. J. Vis. Exp. (190), e64953, doi:10.3791/64953 (2022).

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