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TACI : un plugin ImageJ pour l’analyse d’imagerie calcique 3D
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TACI: An ImageJ Plugin for 3D Calcium Imaging Analysis
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TACI : un plugin ImageJ pour l’analyse d’imagerie calcique 3D

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09:39 min

•

December 16, 2022

DOI:

10.3791/64953-v

DOI:
10.3791/64953-v

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09:39 min
December 16, 2022

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1School of Neuroscience,Virginia Polytechnic Institute and State University, 2CMU-Pitt Joint Computational Biology, School of Medicine,University of Pittsburgh, 3Eastern Virginia Medical School, 4Department of Physics,University of Miami

Summary

Automatically generated

TrackMate Analysis of Calcium Imaging (TACI) est un plugin ImageJ open-source pour l’analyse 3D de l’imagerie calcique qui examine le mouvement sur l’axe z et identifie la valeur maximale de chaque pile z pour représenter l’intensité d’une cellule au point de temps correspondant. Il peut séparer les neurones qui se chevauchent dans la direction latérale (x / y) mais sur des plans z différents.

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3D Calcium ImagingImageJ PluginTACIMotion CorrectionZ-driftTemperature RecordingPeltierTIFF File RenamingTIFF File Organizing

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Omelchenko, A. A., Bai, H., Hussain, S., Tyrrell, J. J., Klein, M., Ni, L. TACI: An ImageJ Plugin for 3D Calcium Imaging Analysis. J. Vis. Exp. (190), e64953, doi:10.3791/64953 (2022).

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