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TACI: un plugin ImageJ per l'analisi 3D dell'imaging del calcio
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TACI: An ImageJ Plugin for 3D Calcium Imaging Analysis
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TACI: un plugin ImageJ per l'analisi 3D dell'imaging del calcio

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09:39 min

•

December 16, 2022

DOI:

10.3791/64953-v

DOI:
10.3791/64953-v

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09:39 min
December 16, 2022

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1School of Neuroscience,Virginia Polytechnic Institute and State University, 2CMU-Pitt Joint Computational Biology, School of Medicine,University of Pittsburgh, 3Eastern Virginia Medical School, 4Department of Physics,University of Miami

Summary

Automatically generated

TrackMate Analysis of Calcium Imaging (TACI) è un plugin ImageJ open source per l'analisi 3D dell'imaging del calcio che esamina il movimento sull'asse z e identifica il valore massimo di ogni z-stack per rappresentare l'intensità di una cella nel punto temporale corrispondente. Può separare i neuroni che si sovrappongono nella direzione laterale (x / y) ma su diversi piani z.

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3D Calcium ImagingImageJ PluginTACIMotion CorrectionZ-driftTemperature RecordingPeltierTIFF File RenamingTIFF File Organizing

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Omelchenko, A. A., Bai, H., Hussain, S., Tyrrell, J. J., Klein, M., Ni, L. TACI: An ImageJ Plugin for 3D Calcium Imaging Analysis. J. Vis. Exp. (190), e64953, doi:10.3791/64953 (2022).

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