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단일 셀 게놈 시퀀싱 초고 처리량 미세 플랫폼
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Journal JoVE Bio-ingénierie
An Ultrahigh-throughput Microfluidic Platform for Single-cell Genome Sequencing
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단일 셀 게놈 시퀀싱 초고 처리량 미세 플랫폼

DOI:
10.3791/57598-v

•

10:00 min

•

May 23, 2018

•

, , ,
1Department of Bioengineering and Therapeutic Sciences, California Institute for Quantitative Biosciences,University of California, San Francisco, 2UC Berkeley-UCSF Graduate Program in Bioengineering,University of California, San Francisco, 3Chan Zuckerberg Biohub

Chapitres

  • 00:05Titre
  • 00:48Encapsulation of Cells in Agarose Microgels
  • 02:48Breaking the Agarose Microgels
  • 03:54Generating Barcode Droplets by Digital PCR
  • 04:53Tagmentation of Genomic DNA in Droplets
  • 05:48Single-cell Barcoding by Microfluidic Double Merger
  • 08:25Results: Ultrahigh Throughput Sequencing of Single-cell Genomes
  • 09:24Conclusion

Summary

Traduction automatique

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단일 셀 시퀀싱 생물 학적 시스템, genotypic이 보여 하지만 현재 기술 커뮤니티 구성 및 기능의 깊은 프로 파일링에 필요한 처리량 부족. 여기, 우리는 미세 워크플로 시퀀싱에 대 한 설명 > 다양 한에서 50000 단일 셀 게놈 세포 인구.

Tags

Single-cellGenome SequencingMicrofluidicsHigh-throughputBarcodingCell LysisAgaroseDroplet GenerationCell EncapsulationGenomic HeterogeneityCell SuspensionPBSSurfactantSyringe PumpTemperature ControlCollectionOil RemovalPFO

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