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Une plate-forme de Microfluidic ultra haute capacité pour le séquençage du génome de cellules individuelles
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Journal JoVE Bio-ingénierie
An Ultrahigh-throughput Microfluidic Platform for Single-cell Genome Sequencing
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Une plate-forme de Microfluidic ultra haute capacité pour le séquençage du génome de cellules individuelles

DOI:
10.3791/57598-v

•

10:00 min

•

May 23, 2018

•

, , ,
1Department of Bioengineering and Therapeutic Sciences, California Institute for Quantitative Biosciences,University of California, San Francisco, 2UC Berkeley-UCSF Graduate Program in Bioengineering,University of California, San Francisco, 3Chan Zuckerberg Biohub

Chapitres

  • 00:05Titre
  • 00:48Encapsulation of Cells in Agarose Microgels
  • 02:48Breaking the Agarose Microgels
  • 03:54Generating Barcode Droplets by Digital PCR
  • 04:53Tagmentation of Genomic DNA in Droplets
  • 05:48Single-cell Barcoding by Microfluidic Double Merger
  • 08:25Results: Ultrahigh Throughput Sequencing of Single-cell Genomes
  • 09:24Conclusion

Summary

Traduction automatique

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Unicellulaire séquençage révèle une hétérogénéité génotypique dans les systèmes biologiques, mais les technologies actuelles n’ont pas le débit nécessaire pour la détermination des caractéristiques profondes de la fonction et la composition de la communauté. Nous décrivons ici un "workflow" microfluidique pour séquençage > 50 000 unicellulaires génomes de diverses populations de cellules.

Tags

Single-cellGenome SequencingMicrofluidicsHigh-throughputBarcodingCell LysisAgaroseDroplet GenerationCell EncapsulationGenomic HeterogeneityCell SuspensionPBSSurfactantSyringe PumpTemperature ControlCollectionOil RemovalPFO

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