Journal
/
Bio-ingénierie
/
Een met-throughput Microfluidic Platform voor eencellige genoom Sequencing
Journal JoVE
Bio-ingénierie
This content is Free Access.
Journal JoVE Bio-ingénierie
An Ultrahigh-throughput Microfluidic Platform for Single-cell Genome Sequencing
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Een met-throughput Microfluidic Platform voor eencellige genoom Sequencing

DOI:
10.3791/57598-v

•

10:00 min

•

May 23, 2018

•

, , ,
1Department of Bioengineering and Therapeutic Sciences, California Institute for Quantitative Biosciences,University of California, San Francisco, 2UC Berkeley-UCSF Graduate Program in Bioengineering,University of California, San Francisco, 3Chan Zuckerberg Biohub

Chapitres

  • 00:05Titre
  • 00:48Encapsulation of Cells in Agarose Microgels
  • 02:48Breaking the Agarose Microgels
  • 03:54Generating Barcode Droplets by Digital PCR
  • 04:53Tagmentation of Genomic DNA in Droplets
  • 05:48Single-cell Barcoding by Microfluidic Double Merger
  • 08:25Results: Ultrahigh Throughput Sequencing of Single-cell Genomes
  • 09:24Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Eencellige sequencing blijkt genotypische heterogeniteit in biologische systemen, maar de huidige technologieën ontbreken de doorvoer die nodig zijn voor de diepe profilering van communautaire samenstelling en functie. Hier beschrijven we een microfluidic workflow voor het rangschikken > 50.000 eencellige genomen uit verschillende cel populaties.

Tags

Single-cellGenome SequencingMicrofluidicsHigh-throughputBarcodingCell LysisAgaroseDroplet GenerationCell EncapsulationGenomic HeterogeneityCell SuspensionPBSSurfactantSyringe PumpTemperature ControlCollectionOil RemovalPFO

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

High-throughput eiwit expressie Generator Met behulp van een Microfluïdische Platform

Microfluidic Picoliter Bioreactor for Microbial Single-cell Analysis: Fabrication, System Setup, and Operation

Cel Knijpen als een robuuste, Microfluidic Intracellular Delivery Platform

Microfluidic Platform voor het meten neutrofielchemotaxis van onverwerkte volbloed

De Multi-orgel Chip - Een Microfluïdische platform voor lange termijn Multi-weefsel Coculture

Een microfluïdische platform voor High-throughput Single-cell Isolatie en Cultuur

Microfluïdische Platform met multiplexverzending elektronische detectie voor ruimtelijke Tracking van Deeltjes

Beeldvorming van de morfologie van het haar van de wortel van Arabidopsis zaailingen in een twee-laag Microfluidic Platform

Een Microfluidic Platform voor het longitudinale beeldvorming in Caenorhabditis elegans

Ultra lange lezen Sequencing voor hele Genomic DNA-analyse

Read Article