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MALDI−TOF質量分析法を用いた酵素分解によるRNA断片の同定

JoVE Revista
Bioquímica

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Identification of RNA Fragments Resulting from Enzymatic Degradation using MALDI-TOF Mass Spectrometry

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MALDI−TOF質量分析法を用いた酵素分解によるRNA断片の同定

DOI:

10.3791/63720-v

•

09:20 min

•

April 11, 2022

•

Shawn W. Schowe, Conner J. Langeberg, Erich G. Chapman, Kitty Brown, Marino J. E. Resendiz

¹Department of Chemistry,University of Colorado, Denver, ²Department of Chemistry & Biochemistry,University of Denver, ³Analytical Resources Core Bioanalysis & Omics,Colorado State University

Capítulos

00:09Introduction
01:05Concentration Determination of RNA Solution
03:15Hydrolysis of Oligonucleotides of RNA by Xrn-1
05:31Desalting of RNA Solution, MALDI-TOF Plate Spotting
07:41Results: Identification of Enzymatically Degraded RNA Fragments Using MALDI-TOF Mass Spectrometry
08:32Conclusion

Summary

Traducción Automática

MALDI−TOFを用いて、酸化されたRNAとエキソリボヌクレアーゼXrn−1との間の反応性から得られた断片を特徴付けた。本プロトコルは、RNAおよび/またはDNAを含む他のプロセスに適用できる方法論を記載する。

Tags

RNA Fragments Enzymatic Degradation MALDI-TOF Mass Spectrometry Biopolymer Characterization Biochemical Transformations UV-Vis Spectrophotometry Peltier Temperature Control

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