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Identifizierung von RNA-Fragmenten aus dem enzymatischen Abbau mittels MALDI-TOF-Massenspektrometrie
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JoVE 杂志 生物化学
Identification of RNA Fragments Resulting from Enzymatic Degradation using MALDI-TOF Mass Spectrometry
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Identifizierung von RNA-Fragmenten aus dem enzymatischen Abbau mittels MALDI-TOF-Massenspektrometrie

DOI:
10.3791/63720-v

•

09:20 min

•

April 11, 2022

•

, , , ,
1Department of Chemistry,University of Colorado, Denver, 2Department of Chemistry & Biochemistry,University of Denver, 3Analytical Resources Core Bioanalysis & Omics,Colorado State University

Chapters

  • 00:09Introduction
  • 01:05Concentration Determination of RNA Solution
  • 03:15Hydrolysis of Oligonucleotides of RNA by Xrn-1
  • 05:31Desalting of RNA Solution, MALDI-TOF Plate Spotting
  • 07:41Results: Identification of Enzymatically Degraded RNA Fragments Using MALDI-TOF Mass Spectrometry
  • 08:32Conclusion

Summary

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MALDI-TOF wurde verwendet, um Fragmente zu charakterisieren, die aus der Reaktivität zwischen oxidierter RNA und der Exoribonuklease Xrn-1 erhalten wurden. Das vorliegende Protokoll beschreibt eine Methodik, die auf andere Prozesse mit RNA und/oder DNA angewendet werden kann.

Tags

RNA FragmentsEnzymatic DegradationMALDI-TOF Mass SpectrometryBiopolymer CharacterizationBiochemical TransformationsUV-Vis SpectrophotometryPeltier Temperature Control

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