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Acinetobacter baumannii O 결합 글리코 펩타이드의 확인을위한 개방형 검색 기반 접근법의 적용
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JoVE 杂志 生物化学
The Application of Open Searching-based Approaches for the Identification of Acinetobacter baumannii O-linked Glycopeptides
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Acinetobacter baumannii O 결합 글리코 펩타이드의 확인을위한 개방형 검색 기반 접근법의 적용

DOI:
10.3791/63242-v

•

08:37 min

•

November 02, 2021

•

, , ,
1Department of Microbiology and Immunology, Peter Doherty Institute for Infection and Immunity,The University of Melbourne

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:44Processing of Proteome Samples
  • 04:01Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS) of Proteome/Glycopeptide-Enriched Samples
  • 04:28Analysis of Proteome/Glycopeptide-Enriched Samples
  • 06:08Results: Open Searching and Glycan-Focused Glycopeptide Searches for Acinetobacter baumannii
  • 07:52Conclusion

Summary

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오픈 서닝은 이전에 알려지지 않은 글리칸 조성물로 장식된 글리코펩티드의 동정을 가능하게 한다. 이 기사에서는 Acinetobacter baumannii 를 모델로 사용하여 박테리아 샘플에 대해 공개 검색 및 후속 글리칸 중심의 글리코 펩티드 검색을 수행하기위한 간소화 된 접근 방식을 제시합니다.

Tags

Acinetobacter BaumanniiO-linked GlycopeptidesOpen SearchingGlycosylationProteomeSTB-RPSZIC-HILICChromatographyEnrichmentMass Spectrometry

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