Vi presenterar ett protokoll för att studera distributionen av mitokonlikers och endoplasmatiska Retikulum i hela celler efter genetisk modifiering med hjälp av korrelat ljus och volymelektronmikroskopi inklusive askorbat peroxidas 2 och pepparrotperoxidasfärgning, seriell snittning av celler med och utan målgenen i samma sektion, och seriell avbildning via elektronmikroskopi.