好気性メタン酸化細菌の自然生息地に見られるメタン-酸素カウンター勾配を再現する単純なモデル生態系を準備するためのプロトコルが説明されており、空間的に解決されたコンテキストでそれらの生理機能を研究できます。また、アガロースベースのモデルエコシステムで使用するための一般的な生化学的アッセイの改良についても説明します。