يتم وصف بروتوكول لإعداد نظام بيئي نموذجي بسيط يعيد إنشاء التدرج المضاد للميثان والأكسجين الموجود في الموائل الطبيعية للبكتيريا المؤكسدة للميثان الهوائية ، مما يتيح دراسة فسيولوجيتها في سياق يتم حله مكانيا. كما تم وصف التعديلات على المقايسات البيوكيميائية الشائعة للاستخدام مع النظام الإيكولوجي النموذجي القائم على الأغاروز.
