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Une approche par graphe de connaissances pour élucider le rôle des voies organellaires dans la maladie via des rapports biomédicaux
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A Knowledge Graph Approach to Elucidate the Role of Organellar Pathways in Disease via Biomedical Reports
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Une approche par graphe de connaissances pour élucider le rôle des voies organellaires dans la maladie via des rapports biomédicaux

français

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07:35 min

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October 13, 2023

DOI:

10.3791/65084-v

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10.3791/65084-v

•

07:35 min
October 13, 2023

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1Department of Physiology,UCLA School of Medicine, 2Scalable Analytics Institute (ScAi) at Department of Computer Science,UCLA School of Engineering, 3NIH BRIDGE2AI Center at UCLA & NHLBI Integrated Cardiovascular Data Science Training Program,UCLA, 4Medical Informatics,University of California at Los Angeles (UCLA), 5Department of Medicine (Cardiology),UCLA School of Medicine

Summary

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Un protocole informatique, CaseOLAP LIFT, et un cas d’utilisation sont présentés pour étudier les protéines mitochondriales et leurs associations avec les maladies cardiovasculaires telles que décrites dans les rapports biomédicaux. Ce protocole peut être facilement adapté pour étudier les composants cellulaires et les maladies sélectionnés par l’utilisateur.

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Knowledge GraphOrganellar PathwaysDiseaseBiomedical ReportsCaseOLAP LIFTProtein Disease AssociationsHypothesis GenerationComputational ProtocolGO TermMeSH TermElasticsearchText MiningGene OntologyMedical Subject Header

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Pelletier, A. R., Steinecke, D., Sigdel, D., Adam, I., Caufield, J. H., Guevara-Gonzalez, V., Ramirez, J., Verma, A., Bali, K., Downs, K., Wang, W., Bui, A., Ping, P. A Knowledge Graph Approach to Elucidate the Role of Organellar Pathways in Disease via Biomedical Reports. J. Vis. Exp. (200), e65084, doi:10.3791/65084 (2023).

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