Journal
/
Genetics
/
Kartläggning av 3D-genominteraktioner hos däggdjur med Micro-C-XL
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetics
Mapping Mammalian 3D Genome Interactions with Micro-C-XL
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Kartläggning av 3D-genominteraktioner hos däggdjur med Micro-C-XL

DOI:
10.3791/64579-v

•

11:41 min

•

November 03, 2023

•

, ,
1Novo Nordisk Foundation Center for Protein Research,University of Copenhagen

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:26MNase Titration
  • 03:07Preparative MNase Digestion
  • 04:43DNA End Processing and Proximity Ligation
  • 06:50Di‐Nucleosomal DNA Purification and Size Selection
  • 07:42Streptavidin Pull‐Down and On‐Bead Library Preparation
  • 08:59Results: Micro‐C Libraries for Mapping the Mammalian 3D Genome Interactions
  • 11:07Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Här presenteras ett protokoll för kartläggning av den tredimensionella genomorganisationen med nukleosomupplösning med hjälp av den genomomfattande kromosomkonformationsmetoden Micro-C-XL.

Tags

3D GenomeMicro-C-XLMNase TitrationNucleosome ResolutionChromatin DigestionDNA PurificationAgarose Gel Electrophoresis

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Konjugativ Parning Analyser för sekvensspecifik analys av Transfer proteiner involverade i konjugation

Genomvid Fastställande av däggdjur Replication Timing av DNA-innehåll Mätning

Kartläggning av RNA-RNA-interaktioner globalt med användning av biotinylerad psoralen

Genomgående kartläggning av protein-DNA-interaktioner med ChEC-seq in<em> Saccharomyces cerevisiae</em

Retroviral Scanning: Kartläggning av MLV-integrationswebbplatser för att definiera cellspecifika reglerande regioner

Mappning av Genome-wide tillgängliga kromatin i primära humana T-lymfocyter av ATAC-Seq

Arrangören Capture-C: Högupplösta, Genome-wide profilering av promotorn interaktioner

Förbättrad genomet redigering med Cas9 ribonukleoprotein i olika celler och organismer

En snabb och kvantitativ metod för posttranslationella modifieringen och Variant aktiverad mappning av peptider till genomen

CRISPR Guide RNA kloning av däggdjur system

Read Article